Meilleur logiciel Facturation Agréé pour Entreprise Individuelle
Découvrez notre classement des meilleurs logiciels de facturation électronique pour entreprises individuelles. Tous les outils présentés sont agréés PA/PDP et conformes à la réforme 2026.
Vous dirigez une entreprise individuelle (EI) et cherchez un logiciel de facturation électronique adapté ? On a testé 8 solutions agréées PA/PDP pour les entrepreneurs individuels au régime réel.
Pourquoi ce comparatif pour les entreprises individuelles ?
L'entreprise individuelle (EI) est un statut juridique qui permet d'exercer en nom propre avec une responsabilité limitée au patrimoine professionnel (depuis 2022). Contrairement à la micro-entreprise, l'EI au régime réel implique une comptabilité plus complète.
Avec la réforme de la facturation électronique 2026, les entreprises individuelles devront être équipées d'un logiciel conforme. La bonne nouvelle : plusieurs solutions sont parfaitement adaptées à ce statut, avec un bon équilibre entre simplicité et fonctionnalités comptables.
On a testé 8 logiciels adaptés aux entreprises individuelles, en évaluant leur gestion du régime réel simplifié et leur rapport qualité/prix.
Notre méthodologie
Test de chaque solution en configuration EI au régime réel
Évaluation de la gestion de la TVA (déclaration, crédit de TVA)
Test de l'export comptable pour l'expert-comptable
Vérification du statut PA/PDP sur le registre officiel de la DGFIP
Analyse du rapport qualité/prix pour les petites structures
Test de la collaboration avec un expert-comptable
Ce classement est établi en toute indépendance. Nous ne percevons aucune commission sur les ventes. Les éditeurs ne peuvent pas payer pour améliorer leur position.
Notre classement
Points forts
Pilotage de trésorerie en temps réel
Synchronisations bancaires et paiements intégrés
Compte pro et cartes inclus pour centraliser les dépenses
Inconvénients
Automatisations avancées limitées sur le plan Basique
Tarifs qui montent avec la taille de l'entreprise et le nombre de salariés
Prix
14€ - 79€/mois HT
Utilisateurs
Par entreprise
Essai gratuit
14 jours
Support
Chat & Email
Points forts
Solution 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessible
320 000 utilisateurs et croissance rapide : adoptée par plus de 12 000 entreprises françaises
Application mobile complète (iOS et Android) avec API pour intégrations avancées + MCP pour la connexion avec les LLMs
Inconvénients
Trop complet pour les micro-entreprises qui n'ont besoin que d'un seul module de gestion
Fonctionnalités limitées pour les ETI et grands comptes nécessitant un ERP avancé
Intégrations tierces moins nombreuses que les leaders internationaux du marché
Prix
À partir de 34,99 € HT/mois
Utilisateurs
1 inclus (+29,99 €/user)
Essai gratuit
14 jours
Support
Chat & Email
Points forts
Suite CRM + facturation native, conforme RGPD et hébergée en France
API REST v2 et intégrations, modules complémentaires (trésorerie)
Applications mobiles iOS et Android pour les équipes terrain
Inconvénients
Tarifs qui augmentent selon les modules et le nombre d'utilisateurs
Interface dense avec une courbe d'apprentissage pour les nouveaux utilisateurs
Offres et options multiples pouvant complexifier le choix
Prix
À partir de 29€/utilisateur/mois
Utilisateurs
2 utilisateurs minimum
Essai gratuit
14 jours
Support
Chat & Email
Autres alternatives à considérer
Indy
4.8
/5
Indy est un logiciel français de comptabilité et de facturation pour indépendants, avec plan gratuit, synchronisation bancaire automatique et compte pro intégré.
Prix:
Gratuit à 49.00€ HT/mois
Plan gratuit disponible
Synchronisation bancaire automatique
Tiime
4.8
/5
Prix:
Gratuit (dès 17.99€ HT/mois)
Facturation gratuite illimitée
Compte pro bancaire intégré
Qonto
4.8
/5
Prix:
À partir de 9€/mois (HT)
Interface et support en français : Conçu pour le marché français, conformité locale
Facturation et comptabilité intégrées : Devis/factures, rapprochement automatique, export vers Sage, Cegid, Pennylane
Henrri
4.8
/5
Prix:
Gratuit (offres payantes dès 17€ TTC/mois)
Factures, devis et utilisateurs illimités en version gratuite
Conforme anti‑fraude TVA et prête pour la facturation électronique 2026
Dougs
4.1
/5
Prix:
Dès 29 € HT/mois
Conseil illimité et réactivité élevée des équipes
Interface simple (web + mobile) avec synchro bancaire
Comparaison détaillée
| Logiciel | Prix | Users | Factu. | FR | Mobile | API |
|---|---|---|---|---|---|---|
 Pennylane 4.6 | 14€ - 79€/mois HT | Par entreprise | ||||
 Axonaut 4.6 | 34,99 € HT/mois | 1 inclus (+29,99 €/user) | ||||
 Sellsy 3.8 | 29€/utilisateur/mois | 2 utilisateurs minimum | ||||
Indy 4.8 | Gratuit à 49.00€ HT/mois | Par entreprise, mensuel/annuel | ||||
Tiime 4.8 | Gratuit (dès 17.99€ HT/mois) | Par entreprise mensuel | ||||
Qonto 4.8 | 9€/mois (HT) | 600 000+ entreprises | ||||
Henrri 4.8 | Gratuit (offres payantes dès 17€ TTC/mois) | Freelances, auto-entrepreneurs, TPE de services et associations | ||||
Dougs 4.1 | Dès 29 € HT/mois | 37000+ entreprises |
Notre conseil
Pour une entreprise individuelle au régime réel, Pennylane est notre recommandation : comptabilité complète, collaboration avec l'expert-comptable, et gestion de la TVA automatisée. Axonaut et Sellsy sont d'excellentes alternatives pour ceux qui veulent aussi un CRM.
Questions
fréquentes
Retrouvez ici les réponses aux questions les plus fréquentes.
Sources
Dernière vérification : 05/02/2026
- 1Liste officielle des PA/PDP
DGFIP - Registre officiel
- 2Le statut d'entreprise individuelle
Ministère de l'Économie
- 3Régime réel simplifié
Service-Public.fr
Comment choisir ?
Le choix du logiciel dépend de votre régime fiscal et de votre collaboration avec un expert-comptable.
Critères essentiels pour entreprise individuelle
Points d'attention