Comparatif Plateformes Agréées Facturation Électronique 2026
Comparatif Plateformes e‑facture 2026 : vous devez vous mettre en conformité avec la facturation électronique, mais quelle plateforme agréée choisir ? Notre guide synthétise les différences entre PDP, PPF et OD, les critères clés (conformité, intégrations, coût total, support), et met en lumière un top 3 clair: Axonaut pour une gestion tout‑en‑un orientée PME, Pennylane pour un pilotage financier avancé et une collaboration comptable fluide, Qonto pour une expérience bancaire et facturation unifiée ultra simple. En quelques minutes, identifiez la solution adaptée à votre taille d’entreprise, à vos outils existants et à vos volumes de factures.
Notre verdict en 30 secondes
Notre analyse de plusieurs solutions PDP/OD de facturation électronique révèle un équilibre crucial entre conformité, intégrations et simplicité d’usage. Axonaut (1er) et Pennylane (2e) se distinguent en tête par leur expérience fluide, l’automatisation et de solides connecteurs comptables. Qonto (3e) complète le podium avec une expérience bancaire et facturation unifiée, idéale pour TPE et indépendants recherchant rapidité et clarté.
Classement
Comparatif Plateformes Agréées Facturation Électronique 2026
Axonaut
🏆 Plateforme Agréée FE2026
Axonaut est un logiciel de gestion tout-en-un français pour TPE et PME qui centralise CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessible.
Points forts
- Solution 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessibles
- 320 000 utilisateurs et croissance rapide : adoptée par plus de 12 000 entreprises françaises
- Application mobile complète (iOS et Android) avec API pour intégrations avancées + MCP pour la connexion avec les LLMs
Incovénients
- Trop complet pour les micro-entreprises qui n'ont besoin que d'un seul module de gestion
- Fonctionnalités limitées pour les ETI et grands comptes nécessitant un ERP avancé
- Intégrations tierces moins nombreuses que les leaders internationaux du marché
Pennylane
🏆 Plateforme Agréée FE2026
Pennylane est le logiciel de comptabilité français tout‑en‑un: facturation électronique, synchronisations bancaires, compte pro et cartes, pilotage de trésorerie en temps réel, collaboration native avec votre expert‑comptable.
Points forts
- Pilotage de trésorerie en temps réel
- Synchronisations bancaires et paiements intégrés
- Compte pro et cartes inclus pour centraliser les dépenses
Incovénients
- Automatisations avancées limitées sur le plan Basique
- Tarifs qui montent avec la taille (jusqu’à 199€/mois pour 6–15 salariés)
Qonto
🏆 Plateforme Agréée FE2026
Points forts
- Interface et support en français - Conçu pour le marché français, conformité locale
- Facturation et comptabilité intégrées - Devis/factures, rapprochement automatique, export vers Sage, Cegid, Pennylane
- Multi-utilisateurs et contrôle des dépenses - Droits granulaires, cartes par collaborateur, suivi en temps réel
Incovénients
- Tarifs des plans supérieurs - Coût mensuel pouvant peser pour les petites structures
- Fonctionnalités avancées en option - Certains modules (factures clients, fournisseurs) sont payants
- Pas de dépôt d'espèces - Moyens pris en charge : virements, cartes, chèques par envoi postal
Exact Online
Points forts
- Comptabilité automatisée : Synchronisation bancaire, lettrage automatique et TVA pour gagner du temps
- Interface en français : Localisation complète et support FR pour une prise en main rapide
- Écosystème intégré : CRM, facturation, stocks et projets dans une même plateforme cloud
Incovénients
- Courbe d'apprentissage : Interface riche qui demande une formation initiale pour exploiter toutes les fonctionnalités avancées
- Prix selon modules : Coût qui augmente rapidement avec l'ajout de modules spécialisés (CRM, projet, industrie)
- Personnalisation limitée : Moins flexible que certains ERP sur mesure pour des besoins très spécifiques
Sinao
Sinao est un logiciel français de comptabilité et de facturation qui automatise la saisie, permet de créer des devis et des factures électroniques conformes, avec export FEC et partage fluide avec votre expert-comptable.
Points forts
- Simplicité d'utilisation : interface intuitive, devis et factures en quelques minutes
- Automatisation comptable : saisie automatique et transfert en un clic vers votre comptable
- Conformité et obligations : export FEC et factures électroniques conformes
Incovénients
- Fonctionnalités limitées version gratuite : L'offre Free ne permet que la création de devis et factures basiques
- Tarifs progressifs : Les fonctionnalités avancées nécessitent un abonnement payant à partir de 12€/mois (en abonnement annuel)
- Spécialisé PME/TPE : Moins adapté aux grandes entreprises avec besoins comptables complexes
Swapn Compta
Points forts
- Expertise comptable certifiée : Cabinet inscrit à l'Ordre des Experts-Comptables avec accompagnement personnalisé et suivi professionnel de votre activité BNC
- Intégration Tiime complète : Application Tiime incluse pour le suivi en temps réel de votre comptabilité et gestion administrative simplifiée
- Tarification transparente : Formule tout inclus à 29€ HT/mois sans engagement avec télétransmission TVA et synchronisation bancaire
Incovénients
- Bilan et liasse en supplément : À partir de 199€ HT/an en plus de l'abonnement
- Outils Tiime facturés séparément : 17,99€ HT/mois après période offerte
- Pas d'API publique : Intégrations limitées hors écosystème Tiime
Libeo
Libeo centralise et automatise le paiement des factures fournisseurs pour les PME : capture des factures, validation multi-niveaux, paiement SEPA en un clic et intégrations comptables, sans ressaisie d’IBAN.
Points forts
- Paiement des factures sans ressaisie IBAN grâce à la reconnaissance automatique
- Validation collaborative des factures avec circuit paramétrable
- Intégration native avec de nombreux logiciels de comptabilité
Incovénients
- Fonctionnalités limitées pour les très grandes entreprises
- Nécessite un temps d'adaptation pour optimiser les workflows
- Options de personnalisation avancées uniquement sur les forfaits supérieurs
Efficy
Points forts
- CRM complet & mobile : Prospection, comptes, opportunités, apps iOS/Android avec agenda et offline
- Devis & facturation : Génération de devis/factures et suivi des revenus dans le CRM
- Intégrations & API : Connecteurs et API pour relier vos outils métier et messageries
Incovénients
- Tarification : Dès 59 €/utilisateur/mois, au‑dessus de certaines alternatives
- Courbe d’apprentissage : Paramétrage avancé et conduite du changement requis
- Fonctionnalités selon plan : Certaines options (ex. facturation) réservées aux offres supérieures
EBP
EBP est l’éditeur français de référence (depuis 1984) pour la comptabilité, la gestion commerciale et la facturation des TPE/PME, avec support local et écosystème d’intégrations.
Points forts
- Éditeur français depuis 1984
- Suite complète pour TPE/PME
- Support et écosystème locaux
Incovénients
- Interface parfois complexe
- Prix élevés certains modules
- Modernisation en cours
Sage Business Cloud Compta & Facturation
Sage Business Cloud Compta & Facturation : comptabilité et facturation en ligne pour TPE, synchronisation bancaire, conformité française (TVA, FEC) et application mobile.
Points forts
- 100% cloud, accessible partout
- Synchronisation bancaire et rapprochement automatisés
- Conformité française (TVA, FEC) et support FR
Incovénients
- Facturation moins avancée que certains concurrents
- Tarifs et options pouvant augmenter selon besoins
- Moins de profondeur fonctionnelle qu’un ERP
Henrri
Henrri est le logiciel de facturation gratuit à vie du groupe Rivalis : factures, devis et utilisateurs illimités, sans publicité, prêt pour la facturation électronique.
Points forts
- Factures, devis et utilisateurs illimités en version gratuite
- Conforme anti‑fraude TVA et prête pour la facturation électronique 2026
- Interface et support 100% français
Incovénients
- Pas d’application mobile complète (iOS "Henrri Pay" pour encaissement uniquement; pas d’app Android)
- API privée, pas d’intégrations publiques (Zapier, webhooks)
- Fonctionnalités avancées et e‑facture disponibles dans des offres payantes
Facture.net
Points forts
- Gratuit à vie, devis et factures illimités
- CRM intégré pour contacts et opportunités
- Paiement en ligne et conformité anti-fraude TVA
Incovénients
- Pas d’application mobile iOS/Android dédiée
- Pas d’API publique documentée
- Fonctionnalités avancées limitées vs solutions payantes
Sage 50
Sage 50 est une solution de comptabilité et de facturation modulaire pour TPE‑PME, avec synchronisation bancaire et automatisations pour gagner du temps.
Points forts
- Synchronisation bancaire automatique
- Automatisation comptable avancée
- Essai gratuit 30 jours
Incovénients
- Application Windows uniquement
- Pas d’app mobile dédiée (add-on limité)
- Mise en route initiale plus technique
Tiime
Points forts
- Facturation gratuite illimitée
- Compte pro bancaire intégré
- Prêt pour la facturation électronique 2026
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes
- Pas de gestion de stock native
- Aucune API publique
Indy
Indy est un logiciel français de comptabilité et de facturation pour indépendants, avec plan gratuit, synchronisation bancaire automatique et compte pro intégré.
Points forts
- Plan gratuit disponible
- Synchronisation bancaire automatique
- Compte pro gratuit intégré
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes
- Conçu surtout pour indépendants
- Pas de service comptable humain intégré
Sellsy
Points forts
- Suite CRM + facturation native, conforme RGPD et hébergée en France
- API REST v2 et intégrations, modules complémentaires (trésorerie)
- Applications mobiles iOS et Android pour les équipes terrain
Incovénients
- Tarifs qui augmentent selon les modules et le nombre d'utilisateurs
- Interface dense avec une courbe d'apprentissage pour les nouveaux utilisateurs
- Offres et options multiples pouvant complexifier le choix
EBP Compta
EBP Compta : comptabilité TPE/PME avec synchronisation bancaire, rapprochements automatiques et TVA automatisée.
Points forts
- Synchronisation bancaire automatique
- Collaboration avec l’expert-comptable intégrée
- Rapprochement automatique des écritures
Incovénients
- Pas d’application mobile dédiée à la comptabilité
- Facturation en module séparé (pack ou Gestion Commerciale)
- Nombre d’utilisateurs limité selon l’abonnement
Evoliz
Evoliz est un logiciel de facturation français tout-en-un pour PME, avec CRM, stocks et comptabilité intégrés.
Points forts
- Certifié NF 203 et NF 525 (conformité fiscale)
- Facturation, banque, stocks et CRM intégrés
- Support client illimité et gratuit
Incovénients
- Fonctionnalités avancées réservées aux plans supérieurs
- Interface moins moderne que certains concurrents
- Peu de modules métiers spécialisés
Ciel
Ciel (Sage) simplifie la comptabilité, la facturation et la gestion commerciale des TPE‑PME en France, avec support local et conformité légale.
Points forts
- Marque Sage (Ciel) historique en France depuis 1986
- Comptabilité et facturation complètes pour TPE‑PME
- Support client et ressources en français
Incovénients
- Interface vieillissante
- Pas d'application mobile native
- Fonctionnalités cloud limitées
JLogiciels
JLogiciels est un éditeur français (depuis 2005) de solutions de gestion modulaires en SaaS : facturation, devis, caisse, stock et CRM pour TPE/PME et artisans.
Points forts
- Solutions sectorielles spécialisées
- 20+ ans d'expérience métier
- Personnalisation avancée
Incovénients
- Tarifs sur devis uniquement
- Moins connu que concurrents
- Interface à moderniser
Sage 100
Sage 100 : ERP modulaire pour PME alliant Comptabilité, Gestion commerciale, Facturation et Paie, conforme aux obligations françaises et pensé pour la croissance.
Points forts
- Suite modulaire PME éprouvée (Compta, Gestion co, Paie)
- Conformité française (FEC, DSN) et support local
- Intégration poussée avec processus métiers
Incovénients
- Interface datée par rapport aux ERP cloud récents
- Coût total élevé sur déploiements complets
- Paramétrage et maintenance nécessitant expertise
Cegid
Cegid est un éditeur français de référence depuis 1983 : une suite cloud modulable pour piloter ERP, comptabilité et RH, accélérer la conformité (DSN, fiscalité) et unifier vos processus de gestion.
Points forts
- Suite cloud ERP, comptabilité et RH modulable
- Expertise métiers et secteurs (compta, paie, retail)
- APIs et intégrations pour connecter l’écosystème
Incovénients
- Tarifs élevés et complexes
- Implémentation longue
- Interface à moderniser
Keobiz
Keobiz est un expert-comptable en ligne qui allie la plateforme Pennylane et l’accompagnement d’un expert dédié pour piloter comptabilité, facturation et TVA des TPE/PME, dès 49,00€/mois.
Points forts
- Tarifs attractifs dès 49,00€/mois et création d’entreprise offerte.
- Accompagnement par un expert dédié, réactif et spécialisé par secteur.
- Outil Pennylane inclus : facturation, OCR, synchronisation bancaire, reporting.
Incovénients
- Tarifs finaux variables selon activité; devis nécessaire.
- Qualité de suivi parfois inégale selon le gestionnaire.
- Pas d’API publique ni d’app mobile Keobiz native (app Pennylane).
Dougs
Dougs est l’expert-comptable en ligne qui automatise votre comptabilité et vous accompagne au quotidien. Synchronisation bancaire, factures conformes et déclarations prises en charge, avec conseil illimité, dès 29€ HT/mois.
Points forts
- Conseil illimité et réactivité élevée des équipes.
- Interface simple (web + mobile) avec synchro bancaire.
- Tarifs transparents dès 29€ HT/mois, bilan et liasse inclus.
Incovénients
- Pas d’interlocuteur dédié sur les offres d’entrée.
- Moins adapté aux structures complexes ou secteurs spécifiques.
- Synchronisation bancaire parfois perfectible selon la banque.
Axonaut 🏆
- Tout-en-un : facturation, CRM, compte pro et bien plus dans une interface intuitive, pensée pour les petites équipes.
- Essayez Axonaut : le logiciel de gestion préféré des entrepreneurs français, déjà adopté par plus de 300 000 utilisateurs.
- Gagnez du temps, évitez les erreurs et centralisez l’essentiel. La gestion devient naturelle, accessible, agréable.
Comparaison détaillée
Axonaut 🏆
Dougs
Keobiz
Exact Online
Sinao
Swapn Compta
Qonto
Libeo
Efficy
Cegid
Sage 100
JLogiciels
Ciel
Evoliz
EBP Compta
Sellsy
Indy
Tiime
Sage 50
Pennylane
Henrri
Facture.net
Sage Business Cloud Compta & Facturation
EBP
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