Meilleur logiciel Facturation Agréé pour Auto-entrepreneur
Découvrez notre classement des meilleurs logiciels de facturation électronique pour auto-entrepreneurs. Tous les outils présentés sont agréés PA/PDP et conformes à la réforme 2026.
Vous êtes auto-entrepreneur et cherchez un logiciel de facturation électronique simple et abordable ? On a testé et comparé 8 solutions agréées PA/PDP adaptées aux freelances et micro-entrepreneurs.
Pourquoi ce comparatif pour les auto-entrepreneurs ?
En tant qu’auto-entrepreneur (ou micro-entrepreneur), vous avez des besoins spécifiques : un logiciel simple à utiliser, abordable, et qui gère automatiquement les spécificités de votre régime fiscal (franchise de TVA, plafonds de chiffre d’affaires, etc.).
Avec la réforme de la facturation électronique 2026, vous devrez être capable de recevoir des factures électroniques dès septembre 2026, et d’en émettre à partir de septembre 2027. Pas de panique : plusieurs solutions sont parfaitement adaptées à votre activité.
On a testé 8 logiciels particulièrement pertinents pour les auto-entrepreneurs et freelances, en évaluant leur simplicité, leur prix, et leur conformité à la réforme.
Notre méthodologie
Test de chaque solution avec un compte réel en configuration auto-entrepreneur
Évaluation de la gestion de la franchise de TVA et des mentions obligatoires
Test de la simplicité d’utilisation et du temps de création d’une facture
Vérification du statut PA/PDP sur le registre officiel de la DGFIP
Analyse du rapport qualité/prix (offres gratuites vs payantes)
Test de l’application mobile pour la facturation en déplacement
Ce classement est établi en toute indépendance. Nous ne percevons aucune commission sur les ventes. Les éditeurs ne peuvent pas payer pour améliorer leur position.
Notre classement
Indy est un logiciel français de comptabilité et de facturation pour indépendants, avec plan gratuit, synchronisation bancaire automatique et compte pro intégré.
Points forts
Plan gratuit disponible
Synchronisation bancaire automatique
Compte pro gratuit intégré
Inconvénients
Fonctionnalités avancées payantes
Conçu surtout pour indépendants
Pas de service comptable humain intégré
Prix
Gratuit à 49.00€ HT/mois
Utilisateurs
Par entreprise, mensuel/annuel
Essai gratuit
14 jours
Support
Chat & Email
Points forts
Factures, devis et utilisateurs illimités en version gratuite
Conforme anti‑fraude TVA et prête pour la facturation électronique 2026
Interface et support 100% français
Inconvénients
Pas d'application mobile complète (iOS "Henrri Pay" pour encaissement uniquement; pas d'app Android)
API privée, pas d'intégrations publiques (Zapier, webhooks)
Fonctionnalités avancées et e‑facture disponibles dans des offres payantes
Prix
Gratuit (offres payantes dès 17€ TTC/mois)
Utilisateurs
Freelances, auto-entrepreneurs, TPE de services et associations
Essai gratuit
14 jours
Support
Chat & Email
Points forts
Facturation gratuite illimitée
Compte pro bancaire intégré
Prêt pour la facturation électronique 2026
Inconvénients
Fonctionnalités avancées payantes
Pas de gestion de stock native
Aucune API publique
Prix
Gratuit (dès 17.99€ HT/mois)
Utilisateurs
Par entreprise mensuel
Essai gratuit
14 jours
Support
Chat & Email
Autres alternatives à considérer
Pennylane
4.6
/5
Prix:
14€ - 79€/mois HT
Pilotage de trésorerie en temps réel
Synchronisations bancaires et paiements intégrés
Axonaut
4.6
/5
Prix:
À partir de 34,99 € HT/mois
Solution 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessible
320 000 utilisateurs et croissance rapide : adoptée par plus de 12 000 entreprises françaises
Qonto
4.8
/5
Prix:
À partir de 9€/mois (HT)
Interface et support en français : Conçu pour le marché français, conformité locale
Facturation et comptabilité intégrées : Devis/factures, rapprochement automatique, export vers Sage, Cegid, Pennylane
Sellsy
3.8
/5
Prix:
À partir de 29€/utilisateur/mois
Suite CRM + facturation native, conforme RGPD et hébergée en France
API REST v2 et intégrations, modules complémentaires (trésorerie)
Dougs
4.1
/5
Prix:
Dès 29 € HT/mois
Conseil illimité et réactivité élevée des équipes
Interface simple (web + mobile) avec synchro bancaire
Comparaison détaillée
| Logiciel | Prix | Users | Factu. | FR | Mobile | API |
|---|---|---|---|---|---|---|
 Indy 4.8 | Gratuit à 49.00€ HT/mois | Par entreprise, mensuel/annuel | ||||
 Henrri 4.8 | Gratuit (offres payantes dès 17€ TTC/mois) | Freelances, auto-entrepreneurs, TPE de services et associations | ||||
 Tiime 4.8 | Gratuit (dès 17.99€ HT/mois) | Par entreprise mensuel | ||||
Pennylane 4.6 | 14€ - 79€/mois HT | Par entreprise | ||||
Axonaut 4.6 | 34,99 € HT/mois | 1 inclus (+29,99 €/user) | ||||
Qonto 4.8 | 9€/mois (HT) | 600 000+ entreprises | ||||
Sellsy 3.8 | 29€/utilisateur/mois | 2 utilisateurs minimum | ||||
Dougs 4.1 | Dès 29 € HT/mois | 37000+ entreprises |
Notre conseil
Pour un auto-entrepreneur, la simplicité prime. Indy est notre recommandation : interface intuitive, gestion automatique de la franchise TVA, et tarif très abordable. Abby et Tiime sont d’excellentes alternatives gratuites pour démarrer.
Questions
fréquentes
Retrouvez ici les réponses aux questions les plus fréquentes.
Sources
Dernière vérification : 05/02/2026
- 1Liste officielle des PA/PDP
DGFIP - Registre officiel
- 2
- 3Calendrier facturation électronique
Ministère de l’Économie
Comment choisir ?
En tant qu’auto-entrepreneur, vos critères de choix sont différents d’une PME. Voici ce qui compte vraiment.
Critères essentiels pour auto-entrepreneur
Points d’attention