Logiciel Facturation Certifié

Comparatif des meilleurs logiciels de facturation certifiés conformes à la réglementation française. Analyses détaillées des fonctionnalités, tarifs et certifications pour choisir la solution adaptée à votre activité. Simplifiez votre gestion comptable tout en respectant les obligations légales de votre entreprise.

Logiciel Facturation Certifié
Ilan Lemos
Ilan Lemos·Expert Logiciel de Gestion
15 janvier 2026
30 janvier 2026
5 min
Méthodologie

Notre verdict en 30 secondes

Notre analyse de 10 logiciels de facturation certifiés révèle un équilibre déterminant entre conformité (piste d’audit, inaltérabilité), richesse fonctionnelle et rapport qualité/prix. Axonaut et Pennylane se distinguent en tête, tandis que Sage 100 complète le podium avec une couverture avancée adaptée aux PME structurées et des intégrations SI solides.

🇫🇷 Axonaut : Certifié et tout-en-un
💎 Pennylane : Conformité garantie moderne
💼 Sage 100 : Certification historique fiable

Logiciel Facturation Certifié

🥇 Top 01
Axonaut

Axonaut

4.6/5

Axonaut est un logiciel de gestion tout-en-un français pour TPE et PME qui centralise CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessible.

Points forts

  • Solution 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessible

  • 320 000 utilisateurs et croissance rapide : adoptée par plus de 12 000 entreprises françaises

  • Application mobile complète (iOS et Android) avec API pour intégrations avancées + MCP pour la connexion avec les LLMs

Inconvénients

  • Trop complet pour les micro-entreprises qui n'ont besoin que d'un seul module de gestion

  • Fonctionnalités limitées pour les ETI et grands comptes nécessitant un ERP avancé

  • Intégrations tierces moins nombreuses que les leaders internationaux du marché

Prix

À partir de 34,99 € HT/mois

Utilisateurs

1 inclus (+29,99 €/user)

Essai gratuit

14 jours

Support

Chat & Email

🥈 Top 02
Pennylane

Pennylane

4.6/5

Pennylane est le logiciel de comptabilité français tout-en-un: facturation électronique, synchronisations bancaires, compte pro et cartes, pilotage de trésorerie en temps réel, collaboration native avec votre expert-comptable.

Points forts

  • Pilotage de trésorerie en temps réel

  • Synchronisations bancaires et paiements intégrés

  • Compte pro et cartes inclus pour centraliser les dépenses

Inconvénients

  • Automatisations avancées limitées sur le plan Basique

  • Tarifs qui montent avec la taille de l'entreprise et le nombre de salariés

Prix

14€ - 79€/mois HT

Utilisateurs

Par entreprise

Essai gratuit

14 jours

Support

Chat & Email

🥉 Top 03
Sage 100

Sage 100

4.0/5

Sage 100 : ERP modulaire pour PME alliant Comptabilité, Gestion commerciale, Facturation et Paie, conforme aux obligations françaises et pensé pour la croissance.

Points forts

  • Suite modulaire PME éprouvée (Compta, Gestion co, Paie)

  • Conformité française (FEC, DSN) et support local

  • Intégration poussée avec processus métiers

Inconvénients

  • Interface datée par rapport aux ERP cloud récents

  • Coût total élevé sur déploiements complets

  • Paramétrage et maintenance nécessitant expertise

Prix

À partir de 78€/mois HT (hébergé)

Utilisateurs

Par module utilisateur

Essai gratuit

14 jours

Support

Chat & Email

Autres alternatives à considérer

💡 Alternative
JLogiciels

JLogiciels

JLogiciels est un éditeur français (depuis 2005) de solutions de gestion modulaires en SaaS : facturation, devis, caisse, stock et CRM pour TPE/PME et artisans.

Prix:

Dès 29€/mois

Solutions sectorielles spécialisées

20+ ans d'expérience métier

💡 Alternative
Facture.net

Facture.net

Facture.net : facturation 100% gratuite à vie avec devis/clients illimités et CRM intégré.

Prix:

Hébergé: 0€/mois

Gratuit à vie, devis et factures illimités

CRM intégré pour contacts et opportunités

💡 Alternative
Qonto

Qonto

Qonto est la solution française de gestion financière pour indépendants et PME : compte pro, cartes, facturation et pilotage des dépenses, intégrations comptables (Sage, Cegid, Pennylane) et API. Essai gratuit 30 jours.

Prix:

À partir de 9€/mois (HT)

Interface et support en français : Conçu pour le marché français, conformité locale

Facturation et comptabilité intégrées : Devis/factures, rapprochement automatique, export vers Sage, Cegid, Pennylane

💡 Alternative
MY.Facturation

MY.Facturation

MY.Facturation simplifie la facturation en ligne : devis, factures et clients en quelques clics, version gratuite et multi-utilisateurs sans surcoût.

Prix:

Gratuit à 50.00€ HT/mois

Interface simple et claire

Tarifs abordables TPE

💡 Alternative
Indy

Indy

Indy est un logiciel français de comptabilité et de facturation pour indépendants, avec plan gratuit, synchronisation bancaire automatique et compte pro intégré.

Prix:

Gratuit à 49.00€ HT/mois

Plan gratuit disponible

Synchronisation bancaire automatique

💡 Alternative
Henrri

Henrri

Henrri est le logiciel de facturation gratuit à vie du groupe Rivalis : factures, devis et utilisateurs illimités, sans publicité, prêt pour la facturation électronique.

Prix:

Gratuit (offres payantes dès 17€ TTC/mois)

Factures, devis et utilisateurs illimités en version gratuite

Conforme anti‑fraude TVA et prête pour la facturation électronique 2026

💡 Alternative
Zervant

Zervant

Zervant est un logiciel de facturation pour freelances et petites entreprises, avec plan gratuit (5 clients/5 factures/mois), e‑factures et envoi postal selon quotas, et applications mobiles iOS/Android.

Prix:

Gratuit, puis 11.00€ à 48.00€/mois

Plan gratuit: 5 clients et 5 factures/mois

Applications mobiles iOS et Android

💡 Alternative
Evoliz

Evoliz

Evoliz est un logiciel de facturation français tout-en-un pour PME, avec CRM, stocks et comptabilité intégrés. Certifié NF 203 et NF 525 pour la conformité fiscale, il permet de gérer l'ensemble de vos processus commerciaux depuis une interface unique.

Prix:

À partir de 16€/mois HT (annuel)

Certifié NF 203 et NF 525 (conformité fiscale)

Facturation, banque, stocks et CRM intégrés

💡 Alternative
Xero

Xero

Xero est un logiciel de comptabilité cloud pour PME : facturation en ligne, rapprochement bancaire automatisé et 1 000+ intégrations. 4,4 M+ abonnés dans le monde.

Prix:

Hébergé: 25–65 €/mois

Rapprochement bancaire automatisé

Écosystème de 1 000+ intégrations

💡 Alternative
Sage Business Cloud Compta & Facturation

Sage Business Cloud Compta & Facturation

Sage Business Cloud Compta & Facturation : comptabilité et facturation en ligne pour TPE, synchronisation bancaire, conformité française (TVA, FEC) et application mobile.

Prix:

9.00€ - 25.00€/mois HT

100% cloud, accessible partout

Synchronisation bancaire et rapprochement automatisés

💡 Alternative
Ciel

Ciel

Ciel (Sage) simplifie la comptabilité, la facturation et la gestion commerciale des TPE‑PME en France, avec support local et conformité légale.

Prix:

À partir de 10,50€/mois

Marque Sage (Ciel) historique en France depuis 1986

Comptabilité et facturation complètes pour TPE‑PME

💡 Alternative
EBP

EBP

EBP est l’éditeur français de référence (depuis 1984) pour la comptabilité, la gestion commerciale et la facturation des TPE/PME, avec support local et écosystème d’intégrations.

Prix:

Dès 50.40€/mois

Éditeur français depuis 1984

Suite complète pour TPE/PME

💡 Alternative
Kolirys

Kolirys

Kolirys est un logiciel de facturation et gestion d'entreprise 100% français et gratuit, certifié conforme loi anti-fraude TVA, conçu pour simplifier la comptabilité des auto-entrepreneurs et PME.

Prix:

Gratuit (dès 9.90€ HT/mois)

Version gratuite complète : Accès 100% gratuit avec devis, factures et clients illimités pour auto-entrepreneurs et entreprises individuelles

Conforme réglementation française : Certifié loi anti-fraude TVA et en cours d'agrément pour facturation électronique 2026

💡 Alternative
Sellsy

Sellsy

Sellsy est une suite CRM et facturation française tout-en-un, avec applications mobiles et API REST. Plébiscitée par 23 000+ clients, elle centralise ventes, devis/factures et trésorerie pour accélérer la croissance des PME.

Prix:

À partir de 29€/utilisateur/mois

Suite CRM + facturation native, conforme RGPD et hébergée en France

API REST v2 et intégrations, modules complémentaires (trésorerie)

💡 Alternative
Cegid

Cegid

Cegid est un éditeur français de référence depuis 1983 : une suite cloud modulable pour piloter ERP, comptabilité et RH, accélérer la conformité (DSN, fiscalité) et unifier vos processus de gestion.

Prix:

À partir de 14.90€ HT/mois

Suite cloud ERP, comptabilité et RH modulable

Expertise métiers et secteurs (compta, paie, retail)

Comparaison détaillée

LogicielPrixUsersFactu.FRMobileAPI
Axonaut
Axonaut
4.6
34,99 € HT/mois1 inclus (+29,99 €/user)
Pennylane
Pennylane
4.6
14€ - 79€/mois HTPar entreprise
Sage 100
Sage 100
4.0
78€/mois HT (hébergé)Par module utilisateur
JLogiciels
JLogiciels
5.0
Dès 29€/moisAbonnement SaaS (par utilisateur)
Facture.net
Facture.net
4.9
Hébergé: 0€/mois100% gratuit illimité
Qonto
Qonto
4.8
9€/mois (HT)600 000+ entreprises
MY.Facturation
MY.Facturation
4.8
Gratuit à 50.00€ HT/moisMulti-utilisateurs illimité
Indy
Indy
4.8
Gratuit à 49.00€ HT/moisPar entreprise, mensuel/annuel
Henrri
Henrri
4.8
Gratuit (offres payantes dès 17€ TTC/mois)Freelances, auto-entrepreneurs, TPE de services et associations
Zervant
Zervant
4.5
Gratuit, puis 11.00€ à 48.00€/moisPar compte (mensuel)
Evoliz
Evoliz
4.4
16€/mois HT (annuel)PME et TPE françaises
Xero
Xero
4.0
Hébergé: 25–65 €/moisUtilisateurs illimités
Sage Business Cloud Compta & Facturation
Sage Business Cloud Compta & Facturation
4.0
9.00€ - 25.00€/mois HTPar entreprise, multi-utilisateurs
Ciel
Ciel
3.9
10,50€/moisTPE et PME françaises
EBP
EBP
3.9
Dès 50.40€/moisLicence perpétuelle & SaaS Cloud
Kolirys
Kolirys
3.8
Gratuit (dès 9.90€ HT/mois)1-50+ utilisateurs
Sellsy
Sellsy
3.8
29€/utilisateur/mois2 utilisateurs minimum
Cegid
Cegid
3.6
14.90€ HT/moisSaaS ou licence par utilisateur

Questions
fréquentes

Vous avez une question ? Nous avons sûrement la réponse. Retrouvez ici les interrogations les plus courantes.