Logiciel de Facturation Certifié 2025
Logiciel de Facturation Certifié 2025 : comparez rapidement les meilleures options pour PME/TPE et choisissez la solution qui vous fera gagner du temps et de la trésorerie. Notre Top 3 met en avant Axonaut (tout‑en‑un facturation + CRM), Evoliz (simplicité et conformité pour TPE) et Sellsy (orientation commerciale avec devis signables et paiements en ligne). Découvrez les critères clés (conformité, automatisations, intégrations, coûts) et nos recommandations selon votre contexte.
Notre verdict en 30 secondes
Notre analyse de 3 solutions de facturation certifiée révèle des écarts marqués sur conformité, ergonomie, automatisations, intégrations et coût total. Axonaut et Evoliz se distinguent en tête: Axonaut pour son tout-en-un (facturation + CRM + pilotage) qui réduit les outils et accélère les relances; Evoliz pour sa simplicité opérationnelle, ses connecteurs bancaires et une mise en route très rapide pour TPE. Sellsy complète le podium avec une forte orientation commerciale (pipelines, devis signables, paiements en ligne), idéale pour aligner ventes et facturation. Selon vos priorités (centralisation, simplicité ou cycle de vente), ces trois logiciels couvrent l’essentiel des besoins PME/TPE.
Classement
Logiciel de Facturation Certifié 2025
Axonaut
🏆 Plateforme Agréée FE2026
Axonaut est un logiciel de gestion tout-en-un français pour TPE et PME qui centralise CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessible.
Points forts
- Solution 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessibles
- 320 000 utilisateurs et croissance rapide : adoptée par plus de 12 000 entreprises françaises
- Application mobile complète (iOS et Android) avec API pour intégrations avancées + MCP pour la connexion avec les LLMs
Incovénients
- Trop complet pour les micro-entreprises qui n'ont besoin que d'un seul module de gestion
- Fonctionnalités limitées pour les ETI et grands comptes nécessitant un ERP avancé
- Intégrations tierces moins nombreuses que les leaders internationaux du marché
Evoliz
🏆 Plateforme Agréée FE2026
Evoliz est un logiciel de facturation français tout-en-un pour PME, avec CRM, stocks et comptabilité intégrés.
Points forts
- Certifié NF 203 et NF 525 (conformité fiscale)
- Facturation, banque, stocks et CRM intégrés
- Support client illimité et gratuit
Incovénients
- Fonctionnalités avancées réservées aux plans supérieurs
- Interface moins moderne que certains concurrents
- Peu de modules métiers spécialisés
Sellsy
🏆 Plateforme Agréée FE2026
Points forts
- Suite CRM + facturation native, conforme RGPD et hébergée en France
- API REST v2 et intégrations, modules complémentaires (trésorerie)
- Applications mobiles iOS et Android pour les équipes terrain
Incovénients
- Tarifs qui augmentent selon les modules et le nombre d'utilisateurs
- Interface dense avec une courbe d'apprentissage pour les nouveaux utilisateurs
- Offres et options multiples pouvant complexifier le choix
Kolirys
Points forts
- Interface 100% française : Solution entièrement adaptée au contexte juridique et fiscal français pour toutes les formes d'entreprises
- Facturation simplifiée : Transformation des devis en factures en un clic avec calcul automatique des délais de paiement
- Synchronisation bancaire : Réconciliation automatique des paiements et suivi de trésorerie en temps réel
Incovénients
- Fonctionnalités CRM limitées : Moins adapté pour les entreprises nécessitant une gestion commerciale avancée
- Personnalisation restreinte : Options de customisation des documents moins étendues que certains concurrents
- Intégrations tierces : Écosystème d'applications partenaires plus restreint
Sage Business Cloud Compta & Facturation
Sage Business Cloud Compta & Facturation : comptabilité et facturation en ligne pour TPE, synchronisation bancaire, conformité française (TVA, FEC) et application mobile.
Points forts
- 100% cloud, accessible partout
- Synchronisation bancaire et rapprochement automatisés
- Conformité française (TVA, FEC) et support FR
Incovénients
- Facturation moins avancée que certains concurrents
- Tarifs et options pouvant augmenter selon besoins
- Moins de profondeur fonctionnelle qu’un ERP
Henrri
Henrri est le logiciel de facturation gratuit à vie du groupe Rivalis : factures, devis et utilisateurs illimités, sans publicité, prêt pour la facturation électronique.
Points forts
- Factures, devis et utilisateurs illimités en version gratuite
- Conforme anti‑fraude TVA et prête pour la facturation électronique 2026
- Interface et support 100% français
Incovénients
- Pas d’application mobile complète (iOS "Henrri Pay" pour encaissement uniquement; pas d’app Android)
- API privée, pas d’intégrations publiques (Zapier, webhooks)
- Fonctionnalités avancées et e‑facture disponibles dans des offres payantes
Facture.net
Points forts
- Gratuit à vie, devis et factures illimités
- CRM intégré pour contacts et opportunités
- Paiement en ligne et conformité anti-fraude TVA
Incovénients
- Pas d’application mobile iOS/Android dédiée
- Pas d’API publique documentée
- Fonctionnalités avancées limitées vs solutions payantes
Dolibarr
Dolibarr est un ERP/CRM open source français, gratuit, avec 50+ modules pour centraliser ventes, facturation et gestion des PME.
Points forts
- Complètement gratuit open source
- 50+ modules disponibles
- ERP + CRM combinés
Incovénients
- Interface complexe débutants
- Support limité version gratuite
- Courbe d'apprentissage difficile
Cegid Business
Cegid Business est un logiciel de facturation et de gestion des stocks pour TPE, simple, conforme et accessible sur web et mobile. Essai gratuit 7 jours.
Points forts
- Facturation et gestion des stocks intégrées
- Applications mobiles iOS & Android
- Essai gratuit 7 jours
Incovénients
- Tarifs non publiés (sur devis)
- Pas d’API publique documentée
Pennylane
Pennylane est le logiciel de comptabilité français tout‑en‑un: facturation électronique, synchronisations bancaires, compte pro et cartes, pilotage de trésorerie en temps réel, collaboration native avec votre expert‑comptable.
Points forts
- Pilotage de trésorerie en temps réel
- Synchronisations bancaires et paiements intégrés
- Compte pro et cartes inclus pour centraliser les dépenses
Incovénients
- Automatisations avancées limitées sur le plan Basique
- Tarifs qui montent avec la taille (jusqu’à 199€/mois pour 6–15 salariés)
Sage 50
Sage 50 est une solution de comptabilité et de facturation modulaire pour TPE‑PME, avec synchronisation bancaire et automatisations pour gagner du temps.
Points forts
- Synchronisation bancaire automatique
- Automatisation comptable avancée
- Essai gratuit 30 jours
Incovénients
- Application Windows uniquement
- Pas d’app mobile dédiée (add-on limité)
- Mise en route initiale plus technique
Tiime
Points forts
- Facturation gratuite illimitée
- Compte pro bancaire intégré
- Prêt pour la facturation électronique 2026
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes
- Pas de gestion de stock native
- Aucune API publique
Zervant
Zervant est un logiciel de facturation pour freelances et petites entreprises, avec plan gratuit (5 clients/5 factures/mois), e‑factures et envoi postal selon quotas, et applications mobiles iOS/Android.
Points forts
- Plan gratuit: 5 clients et 5 factures/mois
- Applications mobiles iOS et Android
- E‑facture et envoi postal inclus selon quotas
Incovénients
- Gratuit limité (5 clients, 5 factures/mois)
- Envois premium contingentés par plan
- Frais sur paiements en ligne et virements
Indy
Indy est un logiciel français de comptabilité et de facturation pour indépendants, avec plan gratuit, synchronisation bancaire automatique et compte pro intégré.
Points forts
- Plan gratuit disponible
- Synchronisation bancaire automatique
- Compte pro gratuit intégré
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes
- Conçu surtout pour indépendants
- Pas de service comptable humain intégré
Sellsy
Points forts
- Suite CRM + facturation native, conforme RGPD et hébergée en France
- API REST v2 et intégrations, modules complémentaires (trésorerie)
- Applications mobiles iOS et Android pour les équipes terrain
Incovénients
- Tarifs qui augmentent selon les modules et le nombre d'utilisateurs
- Interface dense avec une courbe d'apprentissage pour les nouveaux utilisateurs
- Offres et options multiples pouvant complexifier le choix
EBP Compta
EBP Compta : comptabilité TPE/PME avec synchronisation bancaire, rapprochements automatiques et TVA automatisée.
Points forts
- Synchronisation bancaire automatique
- Collaboration avec l’expert-comptable intégrée
- Rapprochement automatique des écritures
Incovénients
- Pas d’application mobile dédiée à la comptabilité
- Facturation en module séparé (pack ou Gestion Commerciale)
- Nombre d’utilisateurs limité selon l’abonnement
Ciel
Ciel (Sage) simplifie la comptabilité, la facturation et la gestion commerciale des TPE‑PME en France, avec support local et conformité légale.
Points forts
- Marque Sage (Ciel) historique en France depuis 1986
- Comptabilité et facturation complètes pour TPE‑PME
- Support client et ressources en français
Incovénients
- Interface vieillissante
- Pas d'application mobile native
- Fonctionnalités cloud limitées
JLogiciels
JLogiciels est un éditeur français (depuis 2005) de solutions de gestion modulaires en SaaS : facturation, devis, caisse, stock et CRM pour TPE/PME et artisans.
Points forts
- Solutions sectorielles spécialisées
- 20+ ans d'expérience métier
- Personnalisation avancée
Incovénients
- Tarifs sur devis uniquement
- Moins connu que concurrents
- Interface à moderniser
MY.Facturation
MY.Facturation simplifie la facturation en ligne : devis, factures et clients en quelques clics, version gratuite et multi-utilisateurs sans surcoût.
Points forts
- Interface simple et claire
- Tarifs abordables TPE
- Fonctionnalités essentielles
Incovénients
- Fonctionnalités limitées
- Pas de CRM avancé
- Solution basique
QuickBooks
QuickBooks est le logiciel de comptabilité en ligne d’Intuit pour PME : facturation, rapprochement bancaire et tableaux de bord, simple et connecté.
Points forts
- Logiciel de comptabilité PME reconnu mondialement
- Écosystème d’intégrations riche
- Interface claire et applications mobiles
Incovénients
- Service et support en français limités (hors Canada)
- Fonctionnalités fiscales France non couvertes
- Mise en conformité locale selon pays à vérifier
Sage 100
Sage 100 : ERP modulaire pour PME alliant Comptabilité, Gestion commerciale, Facturation et Paie, conforme aux obligations françaises et pensé pour la croissance.
Points forts
- Suite modulaire PME éprouvée (Compta, Gestion co, Paie)
- Conformité française (FEC, DSN) et support local
- Intégration poussée avec processus métiers
Incovénients
- Interface datée par rapport aux ERP cloud récents
- Coût total élevé sur déploiements complets
- Paramétrage et maintenance nécessitant expertise
Cegid
Cegid est un éditeur français de référence depuis 1983 : une suite cloud modulable pour piloter ERP, comptabilité et RH, accélérer la conformité (DSN, fiscalité) et unifier vos processus de gestion.
Points forts
- Suite cloud ERP, comptabilité et RH modulable
- Expertise métiers et secteurs (compta, paie, retail)
- APIs et intégrations pour connecter l’écosystème
Incovénients
- Tarifs élevés et complexes
- Implémentation longue
- Interface à moderniser
WaveSoft
Points forts
- Comptabilité et gestion certifiées NF203 (conformité et fiabilité)
- ERP tout-en-un : gestion commerciale, CRM et comptabilité intégrées
- Modèles d'acquisition flexibles : licence perpétuelle ou souscription à l'usage
Incovénients
- Interface moins moderne comparée aux solutions cloud récentes
- Courbe d'apprentissage importante pour exploiter toutes les fonctionnalités avancées
- Coût élevé pour les très petites entreprises avec les packs complets
Keobiz
Keobiz est un expert-comptable en ligne qui allie la plateforme Pennylane et l’accompagnement d’un expert dédié pour piloter comptabilité, facturation et TVA des TPE/PME, dès 49,00€/mois.
Points forts
- Tarifs attractifs dès 49,00€/mois et création d’entreprise offerte.
- Accompagnement par un expert dédié, réactif et spécialisé par secteur.
- Outil Pennylane inclus : facturation, OCR, synchronisation bancaire, reporting.
Incovénients
- Tarifs finaux variables selon activité; devis nécessaire.
- Qualité de suivi parfois inégale selon le gestionnaire.
- Pas d’API publique ni d’app mobile Keobiz native (app Pennylane).
Dougs
Dougs est l’expert-comptable en ligne qui automatise votre comptabilité et vous accompagne au quotidien. Synchronisation bancaire, factures conformes et déclarations prises en charge, avec conseil illimité, dès 29€ HT/mois.
Points forts
- Conseil illimité et réactivité élevée des équipes.
- Interface simple (web + mobile) avec synchro bancaire.
- Tarifs transparents dès 29€ HT/mois, bilan et liasse inclus.
Incovénients
- Pas d’interlocuteur dédié sur les offres d’entrée.
- Moins adapté aux structures complexes ou secteurs spécifiques.
- Synchronisation bancaire parfois perfectible selon la banque.
Freebe
Freebe est le logiciel de facturation et de gestion pensé pour les freelances en France : devis et factures conformes, synchronisation bancaire, relances et déclaration URSSAF automatisées. Essai gratuit 30 jours.
Points forts
- Interface simple et rapide : devis/factures en quelques clics, préremplissage SIRET et TVA.
- Automatisations clés pour freelances : livre des recettes/achats, relances, déclaration URSSAF.
- Synchronisation bancaire (450+ banques) et paiements en ligne via Stripe.
Incovénients
- Pas d’application mobile native (iOS/Android retirées depuis 2023).
- Peu adapté au multi-utilisateurs et aux équipes.
- Rythme d’évolutions fonctionnelles perçu comme plus lent.
INFast
INFast est un logiciel français de facturation et de gestion commerciale pour indépendants, TPE et PME. Créez devis et factures, relancez les impayés, encaissez en ligne et facturez même hors connexion. Essai gratuit 30 jours.
Points forts
- Interface simple et prise en main rapide
- Mode hors ligne (PWA), facturation partout
- Support réactif 7j/7 et paiements en ligne
Incovénients
- Personnalisation des documents limitée
- Analytique et KPI perfectibles
- Pas d’app mobile native iOS/Android
Comparaison détaillée
Axonaut 🏆
INFast
Freebe
Dougs
Keobiz
Kolirys
WaveSoft
Cegid
Sage 100
QuickBooks
JLogiciels
MY.Facturation
Ciel
Evoliz
EBP Compta
Sellsy
Indy
Zervant
Tiime
Sage 50
Pennylane
Cegid Business
Dolibarr
Henrri
Facture.net
Sage Business Cloud Compta & Facturation
Questions
fréquentes
Vous avez une question ? Nous avons sûrement la réponse.
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Le meilleur logiciel de facturation certifié en 2025 dépend de votre contexte (volume de pièces, nombre d’utilisateurs, besoin de CRM, intégrations et budget). Dans notre Top 3, Axonaut arrive premier pour son approche tout-en-un (facturation, CRM, pilotage), Evoliz séduit par sa simplicité opérationnelle et sa conformité, et Sellsy par son orientation commerciale (devis signables, pipeline, paiements).
Si vous cherchez un périmètre large avec relances automatiques, paiements en ligne, gestion de devis et reporting, Axonaut offre un excellent compromis: une vue 360 client et des automatismes qui réduisent le temps passé à facturer et à suivre les impayés. Pour une TPE ou un cabinet de services qui veut aller à l’essentiel, Evoliz brille par son interface claire, ses modèles et ses connecteurs bancaires utiles au quotidien.
Lorsque l’alignement ventes-facturation est central (prospection, opportunités, signature, encaissement), Sellsy propose une continuité commerciale fluide. En résumé, il n’existe pas un unique « meilleur logiciel de facturation certifié en 2025 », mais un meilleur choix par priorité: Axonaut pour la centralisation, Evoliz pour la simplicité et la mise en route rapide, Sellsy pour la performance commerciale. Testez au moins deux démos avec votre scénario (devis → signature → facture → paiement) pour valider ergonomie, intégrations et coût total.
Pour choisir un logiciel de facturation certifié pour PME, partez de vos usages concrets: volumes de devis/factures/avoirs, rôles par personne, workflows de validation, intégrations requises (banque, comptabilité, e‑commerce, CRM). Évaluez ensuite trois axes: conformité, efficacité opérationnelle et coût total (abonnement, modules, temps passé).
Listez vos incontournables: numérotation et mentions légales, multi‑TVA, devis → facture, paiements en ligne, relances automatiques, export comptable. Ajoutez vos accélérateurs: modèles, automatisations, connecteurs, application mobile, signatures, tableaux de bord. Comparez 2 à 3 solutions sur un même parcours: créer un devis, le faire signer, convertir en facture, encaisser et relancer. Vous verrez vite laquelle réduit le plus les clics et les frictions.
Concrètement, Axonaut convient si vous cherchez facturation + CRM + pilotage dans un seul outil; Evoliz excelle pour une mise en route simple orientée TPE; Sellsy est pertinent si le pipeline commercial est central. Pour bien choisir un logiciel de facturation certifié, vérifiez aussi le support (SLA, chat), la migration des données (clients, produits, historiques), la disponibilité d’API et la transparence tarifaire. Faites un essai gratuit et impliquez la personne qui facture au quotidien: son feedback d’ergonomie est décisif.
Les différences entre Axonaut, Evoliz et Sellsy tiennent au périmètre fonctionnel et à l’orientation métier. Axonaut est un tout‑en‑un pragmatique (facturation certifiée, CRM, pilotage) qui centralise la relation client, les documents et les relances: idéal pour PME/TPE voulant limiter le nombre d’outils.
Evoliz mise sur la simplicité opérationnelle: interface épurée, création de devis/factures rapide, connecteurs bancaires et automatisations utiles. La courbe d’apprentissage est courte, ce qui plaît aux équipes terrain et aux dirigeants qui veulent des bases saines sans complexité.
Sellsy se distingue par son ADN commercial: prospection, pipelines, devis signables, suivi d’opportunités et paiements en ligne. C’est un bon choix si l’alignement ventes‑facturation et la visibilité sur le cycle de vente sont prioritaires. En bref, les différences entre Axonaut, Evoliz et Sellsy se résument à: centralisation et polyvalence (Axonaut), simplicité quotidienne (Evoliz), orientation commerciale (Sellsy). Choisissez selon vos priorités, testez deux essais et mesurez le temps gagné sur un scénario réel.


























