Logiciel de facturation auto-entrepreneur
Vous comparez un logiciel de facturation auto-entrepreneur pour gagner du temps et rester conforme ? Découvrez notre top 3 2025 : Axonaut, Freebe et Indy. En quelques minutes, identifiez l’outil qui colle à votre besoin principal : tout-en-un évolutif (Axonaut), automatisations clés pour AE avec gratuité limitée (Freebe), ou pack facturation + comptabilité + compte pro gratuit (Indy). On vous guide vers un choix clair, sans jargon, avec des bénéfices concrets pour votre quotidien d’indépendant.
Notre verdict en 30 secondes
Notre analyse de 3 solutions de logiciels de facturation pour auto-entrepreneurs révèle un équilibre entre prix, simplicité, automatisation et pilotage. Axonaut et Freebe se distinguent en tête : Axonaut pour son tout-en-un évolutif (facturation + CRM) et Freebe pour son approche 100% indépendante avec gratuité jusqu’à 10 factures, synchronisation bancaire et automatisations URSSAF. Indy complète le podium en apportant un trio puissant facturation + comptabilité + compte pro gratuit, avec synchronisation bancaire automatique, idéal pour centraliser l’administratif des indépendants français.
Classement
Logiciel de facturation auto-entrepreneur
Axonaut
🏆 Plateforme Agréée FE2026
Axonaut est un logiciel de gestion tout-en-un français pour TPE et PME qui centralise CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessible.
Points forts
- Solution 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessibles
- 320 000 utilisateurs et croissance rapide : adoptée par plus de 12 000 entreprises françaises
- Application mobile complète (iOS et Android) avec API pour intégrations avancées + MCP pour la connexion avec les LLMs
Incovénients
- Trop complet pour les micro-entreprises qui n'ont besoin que d'un seul module de gestion
- Fonctionnalités limitées pour les ETI et grands comptes nécessitant un ERP avancé
- Intégrations tierces moins nombreuses que les leaders internationaux du marché
Freebe
🏆 Plateforme Agréée FE2026
Freebe est le logiciel de facturation et de gestion pensé pour les freelances en France : devis et factures conformes, synchronisation bancaire, relances et déclaration URSSAF automatisées. Essai gratuit 30 jours.
Points forts
- Interface simple et rapide : devis/factures en quelques clics, préremplissage SIRET et TVA.
- Automatisations clés pour freelances : livre des recettes/achats, relances, déclaration URSSAF.
- Synchronisation bancaire (450+ banques) et paiements en ligne via Stripe.
Incovénients
- Pas d’application mobile native (iOS/Android retirées depuis 2023).
- Peu adapté au multi-utilisateurs et aux équipes.
- Rythme d’évolutions fonctionnelles perçu comme plus lent.
Indy
🏆 Plateforme Agréée FE2026
Indy est un logiciel français de comptabilité et de facturation pour indépendants, avec plan gratuit, synchronisation bancaire automatique et compte pro intégré.
Points forts
- Plan gratuit disponible
- Synchronisation bancaire automatique
- Compte pro gratuit intégré
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes
- Conçu surtout pour indépendants
- Pas de service comptable humain intégré
Sinao
Sinao est un logiciel français de comptabilité et de facturation qui automatise la saisie, permet de créer des devis et des factures électroniques conformes, avec export FEC et partage fluide avec votre expert-comptable.
Points forts
- Simplicité d'utilisation : interface intuitive, devis et factures en quelques minutes
- Automatisation comptable : saisie automatique et transfert en un clic vers votre comptable
- Conformité et obligations : export FEC et factures électroniques conformes
Incovénients
- Fonctionnalités limitées version gratuite : L'offre Free ne permet que la création de devis et factures basiques
- Tarifs progressifs : Les fonctionnalités avancées nécessitent un abonnement payant à partir de 12€/mois (en abonnement annuel)
- Spécialisé PME/TPE : Moins adapté aux grandes entreprises avec besoins comptables complexes
Kolirys
Points forts
- Version gratuite complète : Accès 100% gratuit avec devis, factures et clients illimités pour auto-entrepreneurs et entreprises individuelles
- Conforme réglementation française : Certifié loi anti-fraude TVA et en cours d'agrément pour facturation électronique 2026
- Application mobile gratuite : Apps iOS et Android incluses sans surcoût avec synchronisation temps réel
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes : Synchronisation bancaire, API et multi-utilisateurs réservés aux offres Business (29€) et Elite (49€)
- Jeune acteur du marché : Créé en 2024, moins d'historique et d'intégrations tierces que concurrents établis
- Personnalisation limitée : Options de customisation des documents moins étendues que solutions premium
Qonto
Points forts
- Interface et support en français - Conçu pour le marché français, conformité locale
- Facturation et comptabilité intégrées - Devis/factures, rapprochement automatique, export vers Sage, Cegid, Pennylane
- Multi-utilisateurs et contrôle des dépenses - Droits granulaires, cartes par collaborateur, suivi en temps réel
Incovénients
- Tarifs des plans supérieurs - Coût mensuel pouvant peser pour les petites structures
- Fonctionnalités avancées en option - Certains modules (factures clients, fournisseurs) sont payants
- Pas de dépôt d'espèces - Moyens pris en charge : virements, cartes, chèques par envoi postal
DailyBiz
DailyBiz est un logiciel de gestion tout-en-un pour TPE et PME : CRM, devis & facturation, gestion commerciale et comptabilité, accessible en ligne.
Points forts
- Solution tout-en-un intégrant CRM, comptabilité et gestion commerciale
- Interface entièrement française adaptée aux TPE et PME
- Optimisation de la prospection commerciale et relation client
Incovénients
- Tarification élevée par rapport à certains concurrents
- Fonctionnalités avancées nécessitent une formation initiale
- Personnalisation limitée pour les besoins très spécifiques
Henrri
Henrri est le logiciel de facturation gratuit à vie du groupe Rivalis : factures, devis et utilisateurs illimités, sans publicité, prêt pour la facturation électronique.
Points forts
- Factures, devis et utilisateurs illimités en version gratuite
- Conforme anti‑fraude TVA et prête pour la facturation électronique 2026
- Interface et support 100% français
Incovénients
- Pas d’application mobile complète (iOS "Henrri Pay" pour encaissement uniquement; pas d’app Android)
- API privée, pas d’intégrations publiques (Zapier, webhooks)
- Fonctionnalités avancées et e‑facture disponibles dans des offres payantes
Facture.net
Points forts
- Gratuit à vie, devis et factures illimités
- CRM intégré pour contacts et opportunités
- Paiement en ligne et conformité anti-fraude TVA
Incovénients
- Pas d’application mobile iOS/Android dédiée
- Pas d’API publique documentée
- Fonctionnalités avancées limitées vs solutions payantes
Pennylane
Pennylane est le logiciel de comptabilité français tout‑en‑un: facturation électronique, synchronisations bancaires, compte pro et cartes, pilotage de trésorerie en temps réel, collaboration native avec votre expert‑comptable.
Points forts
- Pilotage de trésorerie en temps réel
- Synchronisations bancaires et paiements intégrés
- Compte pro et cartes inclus pour centraliser les dépenses
Incovénients
- Automatisations avancées limitées sur le plan Basique
- Tarifs qui montent avec la taille (jusqu’à 199€/mois pour 6–15 salariés)
Tiime
Points forts
- Facturation gratuite illimitée
- Compte pro bancaire intégré
- Prêt pour la facturation électronique 2026
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes
- Pas de gestion de stock native
- Aucune API publique
Zervant
Zervant est un logiciel de facturation pour freelances et petites entreprises, avec plan gratuit (5 clients/5 factures/mois), e‑factures et envoi postal selon quotas, et applications mobiles iOS/Android.
Points forts
- Plan gratuit: 5 clients et 5 factures/mois
- Applications mobiles iOS et Android
- E‑facture et envoi postal inclus selon quotas
Incovénients
- Gratuit limité (5 clients, 5 factures/mois)
- Envois premium contingentés par plan
- Frais sur paiements en ligne et virements
Sellsy
Points forts
- Suite CRM + facturation native, conforme RGPD et hébergée en France
- API REST v2 et intégrations, modules complémentaires (trésorerie)
- Applications mobiles iOS et Android pour les équipes terrain
Incovénients
- Tarifs qui augmentent selon les modules et le nombre d'utilisateurs
- Interface dense avec une courbe d'apprentissage pour les nouveaux utilisateurs
- Offres et options multiples pouvant complexifier le choix
MaCompta
MaCompta est un logiciel français de comptabilité et de facturation en ligne pour TPE, indépendants et associations : tarifs dès 8€ HT, modules à la carte (paie, immobilisations) et essai gratuit 30 jours.
Points forts
- 100 000+ utilisateurs en France, éditeur français
- Tarifs clairs : facturation dès 8€ HT, comptabilité 15,90€ HT
- Applications mobiles iOS et Android (compta, factures, notes)
Incovénients
- Modules avancés payants (paie, immobilisations)
- Fonctionnalités plus basiques que certains ERP
- Interface parfois datée
EBP Compta
EBP Compta : comptabilité TPE/PME avec synchronisation bancaire, rapprochements automatiques et TVA automatisée.
Points forts
- Synchronisation bancaire automatique
- Collaboration avec l’expert-comptable intégrée
- Rapprochement automatique des écritures
Incovénients
- Pas d’application mobile dédiée à la comptabilité
- Facturation en module séparé (pack ou Gestion Commerciale)
- Nombre d’utilisateurs limité selon l’abonnement
Evoliz
Evoliz est un logiciel de facturation français tout-en-un pour PME, avec CRM, stocks et comptabilité intégrés.
Points forts
- Certifié NF 203 et NF 525 (conformité fiscale)
- Facturation, banque, stocks et CRM intégrés
- Support client illimité et gratuit
Incovénients
- Fonctionnalités avancées réservées aux plans supérieurs
- Interface moins moderne que certains concurrents
- Peu de modules métiers spécialisés
Ciel
Ciel (Sage) simplifie la comptabilité, la facturation et la gestion commerciale des TPE‑PME en France, avec support local et conformité légale.
Points forts
- Marque Sage (Ciel) historique en France depuis 1986
- Comptabilité et facturation complètes pour TPE‑PME
- Support client et ressources en français
Incovénients
- Interface vieillissante
- Pas d'application mobile native
- Fonctionnalités cloud limitées
MY.Facturation
MY.Facturation simplifie la facturation en ligne : devis, factures et clients en quelques clics, version gratuite et multi-utilisateurs sans surcoût.
Points forts
- Interface simple et claire
- Tarifs abordables TPE
- Fonctionnalités essentielles
Incovénients
- Fonctionnalités limitées
- Pas de CRM avancé
- Solution basique
QuickBooks
QuickBooks est le logiciel de comptabilité en ligne d’Intuit pour PME : facturation, rapprochement bancaire et tableaux de bord, simple et connecté.
Points forts
- Logiciel de comptabilité PME reconnu mondialement
- Écosystème d’intégrations riche
- Interface claire et applications mobiles
Incovénients
- Service et support en français limités (hors Canada)
- Fonctionnalités fiscales France non couvertes
- Mise en conformité locale selon pays à vérifier
Xero
Xero est un logiciel de comptabilité cloud pour PME : facturation en ligne, rapprochement bancaire automatisé et 1 000+ intégrations. 4,4 M+ abonnés dans le monde.
Points forts
- Rapprochement bancaire automatisé
- Écosystème de 1 000+ intégrations
- Utilisateurs illimités, collaboration facile
Incovénients
- Adaptation française limitée
- Conformité fiscale FR incomplète
- Support français limité
Keobiz
Keobiz est un expert-comptable en ligne qui allie la plateforme Pennylane et l’accompagnement d’un expert dédié pour piloter comptabilité, facturation et TVA des TPE/PME, dès 49,00€/mois.
Points forts
- Tarifs attractifs dès 49,00€/mois et création d’entreprise offerte.
- Accompagnement par un expert dédié, réactif et spécialisé par secteur.
- Outil Pennylane inclus : facturation, OCR, synchronisation bancaire, reporting.
Incovénients
- Tarifs finaux variables selon activité; devis nécessaire.
- Qualité de suivi parfois inégale selon le gestionnaire.
- Pas d’API publique ni d’app mobile Keobiz native (app Pennylane).
Dougs
Dougs est l’expert-comptable en ligne qui automatise votre comptabilité et vous accompagne au quotidien. Synchronisation bancaire, factures conformes et déclarations prises en charge, avec conseil illimité, dès 29€ HT/mois.
Points forts
- Conseil illimité et réactivité élevée des équipes.
- Interface simple (web + mobile) avec synchro bancaire.
- Tarifs transparents dès 29€ HT/mois, bilan et liasse inclus.
Incovénients
- Pas d’interlocuteur dédié sur les offres d’entrée.
- Moins adapté aux structures complexes ou secteurs spécifiques.
- Synchronisation bancaire parfois perfectible selon la banque.
INFast
INFast est un logiciel français de facturation et de gestion commerciale pour indépendants, TPE et PME. Créez devis et factures, relancez les impayés, encaissez en ligne et facturez même hors connexion. Essai gratuit 30 jours.
Points forts
- Interface simple et prise en main rapide
- Mode hors ligne (PWA), facturation partout
- Support réactif 7j/7 et paiements en ligne
Incovénients
- Personnalisation des documents limitée
- Analytique et KPI perfectibles
- Pas d’app mobile native iOS/Android
Invoice Home
Invoice Home est un logiciel de facturation en ligne simple et abordable pour créer devis, factures et reçus en quelques clics, avec 100+ modèles et paiements Stripe/PayPal.
Points forts
- Interface ultra simple, prise en main immédiate.
- 100+ modèles de facture pro + logos gratuits.
- Plan gratuit et illimité à 9.00 $/mois, excellent rapport qualité/prix.
Incovénients
- Pas d’API publique ni d’intégrations avancées.
- Filigrane et plafond 1 000 $/30j sur le plan gratuit.
- Avis d’utilisateurs sur des annulations d’abonnement difficiles.
Axonaut 🏆
- Tout-en-un : facturation, CRM, compte pro et bien plus dans une interface intuitive, pensée pour les petites équipes.
- Essayez Axonaut : le logiciel de gestion préféré des entrepreneurs français, déjà adopté par plus de 300 000 utilisateurs.
- Gagnez du temps, évitez les erreurs et centralisez l’essentiel. La gestion devient naturelle, accessible, agréable.
Comparaison détaillée
Axonaut 🏆
Invoice Home
INFast
Freebe
Dougs
Keobiz
Sinao
Kolirys
Qonto
DailyBiz
Xero
QuickBooks
MY.Facturation
Ciel
Evoliz
EBP Compta
MaCompta
Sellsy
Indy
Zervant
Tiime
Pennylane
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