Logiciel Comptable PME
Comparatif des meilleurs logiciels de comptabilité dédiés aux PME françaises. Analyses approfondies des fonctionnalités, tarifs, conformité fiscale et intégrations pour optimiser votre gestion comptable. Trouvez la solution comptable qui automatise vos processus et fait gagner du temps à votre entreprise.
Notre verdict en 30 secondes
Notre analyse de 9 solutions de logiciels comptables pour PME révèle un classement fondé sur l’ergonomie, l’automatisation, les intégrations et le rapport qualité-prix. Axonaut arrive en tête pour son approche tout-en-un orientée PME et son support réactif, Sage 100 se distingue par sa robustesse, ses workflows avancés et son écosystème d’intégrateurs, tandis qu’EBP Compta complète le podium avec une analytique performante pour piloter par projets et centres de coûts.
Classement
Logiciel Comptable PME
Axonaut
Axonaut est un logiciel de gestion tout-en-un français pour TPE et PME qui centralise CRM, facturation, comptabilité et gestion de projets dans une interface intuitive et accessible.
Points forts
- Solution 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessibles
- 32 000 utilisateurs et croissance rapide : adoptée par plus de 12 000 entreprises françaises
- Application mobile complète (iOS et Android) avec API pour intégrations avancées + MCP pour la connexion avec les LLMs
Incovénients
- Trop complet pour les micro-entreprises qui n'ont besoin que d'un seul module de gestion
- Fonctionnalités limitées pour les ETI et grands comptes nécessitant un ERP avancé
- Intégrations tierces moins nombreuses que les leaders internationaux du marché
EBP Compta
EBP Compta : comptabilité TPE/PME avec synchronisation bancaire, rapprochements automatiques et TVA automatisée.
Points forts
- Synchronisation bancaire automatique
- Collaboration avec l’expert-comptable intégrée
- Rapprochement automatique des écritures
Incovénients
- Pas d’application mobile dédiée à la comptabilité
- Facturation en module séparé (pack ou Gestion Commerciale)
- Nombre d’utilisateurs limité selon l’abonnement
Sage 100
Sage 100 : ERP modulaire pour PME alliant Comptabilité, Gestion commerciale, Facturation et Paie, conforme aux obligations françaises et pensé pour la croissance.
Points forts
- Suite modulaire PME éprouvée (Compta, Gestion co, Paie)
- Conformité française (FEC, DSN) et support local
- Intégration poussée avec processus métiers
Incovénients
- Interface datée par rapport aux ERP cloud récents
- Coût total élevé sur déploiements complets
- Paramétrage et maintenance nécessitant expertise
Cegid Quadra
Cegid Quadra est l’ERP cloud dédié aux cabinets d’expertise comptable : comptabilité, paie, facturation et GED intégrées, EDI et télédéclarations. Une plateforme 100% française pour automatiser vos flux et gagner en productivité.
Points forts
- Suite métier intégrée: Comptabilité, paie, facturation, GED et EDI pour cabinets d’expertise comptable
- Automatisation & intégrations: Collecte et imputation intelligentes, API (Cegid Data Access/File Exchange)
- Cloud managé + mobile: Hébergement Cegid Cloud et app QuadraBox pour travailler en mobilité
Incovénients
- Tarifs sur devis: Coût total potentiellement élevé selon modules et volumes
- Courbe d’apprentissage: Richesse fonctionnelle nécessitant formation
- Focalisé cabinets: Moins adapté hors expertise comptable
Sage Intacct
Points forts
- ERP cloud natif spécialement conçu pour la gestion financière avec des fonctionnalités avancées de reporting en temps réel
- Intégrations poussées avec API REST native permettant de connecter facilement vos outils métier existants
- Secteurs spécialisés avec des solutions dédiées pour le manufacturing et les entreprises de services
Incovénients
- Prix sur devis uniquement sans transparence tarifaire pour évaluer le coût réel avant démonstration
- Complexité nécessitant souvent un accompagnement pour l'implémentation et la formation des équipes
- Ciblage PME/ETI peut être surdimensionné pour très petites structures avec besoins comptables basiques
EBP
EBP est l’éditeur français de référence (depuis 1984) pour la comptabilité, la gestion commerciale et la facturation des TPE/PME, avec support local et écosystème d’intégrations.
Points forts
- Éditeur français depuis 1984
- Suite complète pour TPE/PME
- Support et écosystème locaux
Incovénients
- Interface parfois complexe
- Prix élevés certains modules
- Modernisation en cours
Pennylane
Pennylane est le logiciel de comptabilité français tout‑en‑un: facturation électronique, synchronisations bancaires, compte pro et cartes, pilotage de trésorerie en temps réel, collaboration native avec votre expert‑comptable.
Points forts
- Pilotage de trésorerie en temps réel
- Synchronisations bancaires et paiements intégrés
- Compte pro et cartes inclus pour centraliser les dépenses
Incovénients
- Automatisations avancées limitées sur le plan Basique
- Tarifs qui montent avec la taille (jusqu’à 199€/mois pour 6–15 salariés)
iPaidThat
iPaidThat automatise la précomptabilité des TPE/PME avec OCR des factures, synchronisation bancaire et facturation intégrée pour gagner du temps et réduire les erreurs.
Points forts
- Automatisation de la collecte et du traitement des factures
- OCR performant et nombreux connecteurs bancaires
- Adossé au Groupe BPCE, gage de pérennité
Incovénients
- Tarifs élevés pour très petites structures
- Interface parfois peu intuitive
- Forte dépendance aux automatisations
Tiime
Points forts
- Facturation gratuite illimitée
- Compte pro bancaire intégré
- Prêt pour la facturation électronique 2026
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes
- Pas de gestion de stock native
- Aucune API publique
Indy
Indy est un logiciel français de comptabilité et de facturation pour indépendants, avec plan gratuit, synchronisation bancaire automatique et compte pro intégré.
Points forts
- Plan gratuit disponible
- Synchronisation bancaire automatique
- Compte pro gratuit intégré
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes
- Conçu surtout pour indépendants
- Pas de service comptable humain intégré
MaCompta
MaCompta est un logiciel français de comptabilité et de facturation en ligne pour TPE, indépendants et associations : tarifs dès 8€ HT, modules à la carte (paie, immobilisations) et essai gratuit 30 jours.
Points forts
- 100 000+ utilisateurs en France, éditeur français
- Tarifs clairs : facturation dès 8€ HT, comptabilité 15,90€ HT
- Applications mobiles iOS et Android (compta, factures, notes)
Incovénients
- Modules avancés payants (paie, immobilisations)
- Fonctionnalités plus basiques que certains ERP
- Interface parfois datée
Ciel
Ciel (Sage) simplifie la comptabilité, la facturation et la gestion commerciale des TPE‑PME en France, avec support local et conformité légale.
Points forts
- Marque Sage (Ciel) historique en France depuis 1986
- Comptabilité et facturation complètes pour TPE‑PME
- Support client et ressources en français
Incovénients
- Interface vieillissante
- Pas d'application mobile native
- Fonctionnalités cloud limitées
QuickBooks
QuickBooks est le logiciel de comptabilité en ligne d’Intuit pour PME : facturation, rapprochement bancaire et tableaux de bord, simple et connecté.
Points forts
- Logiciel de comptabilité PME reconnu mondialement
- Écosystème d’intégrations riche
- Interface claire et applications mobiles
Incovénients
- Service et support en français limités (hors Canada)
- Fonctionnalités fiscales France non couvertes
- Mise en conformité locale selon pays à vérifier
Xero
Xero est un logiciel de comptabilité cloud pour PME : facturation en ligne, rapprochement bancaire automatisé et 1 000+ intégrations. 4,4 M+ abonnés dans le monde.
Points forts
- Rapprochement bancaire automatisé
- Écosystème de 1 000+ intégrations
- Utilisateurs illimités, collaboration facile
Incovénients
- Adaptation française limitée
- Conformité fiscale FR incomplète
- Support français limité
Axonaut 🏆
- Tout-en-un : facturation, CRM, compte pro et bien plus dans une interface intuitive, pensée pour les petites équipes.
- Essayez Axonaut : le logiciel de gestion préféré des entrepreneurs français, déjà adopté par plus de 300 000 utilisateurs.
- Gagnez du temps, évitez les erreurs et centralisez l’essentiel. La gestion devient naturelle, accessible, agréable.
Comparaison détaillée
Axonaut 🏆
Cegid Quadra
Sage Intacct
Xero
QuickBooks
Ciel
EBP Compta
MaCompta
Indy
Tiime
iPaidThat
Pennylane
EBP
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