Logiciel Comptabilite Auto Entrepreneur

Auto-entrepreneur, vous cherchez un logiciel simple pour gerer vos devis, factures et suivre votre chiffre d'affaires sans vous perdre dans la comptabilite ? Bonne nouvelle : le regime micro-entreprise beneficie d'obligations allegees et des solutions gratuites ou tres accessibles existent. Notre analyse de 35 logiciels vous guide vers l'outil adapte a votre activite et votre budget.

Logiciel Comptabilite Auto Entrepreneur
Ilan Lemos
Ilan Lemos·Expert Logiciel de Gestion
15 janvier 2026
30 janvier 2026
8 min
Méthodologie

Notre verdict en 30 secondes

Notre analyse de 35 logiciels comptabilite auto-entrepreneur revele des solutions pour tous les budgets et niveaux d'exigence. Indy se distingue par son approche tout-en-un specialisee auto-entrepreneurs avec synchronisation bancaire et accompagnement integre. Freebe impressionne par sa simplicite et son offre gratuite dediee aux freelances et auto-entrepreneurs, tandis qu'Henrri complete le podium comme reference 100% gratuite pour facturer sans frais ni limite.

🏆 Indy : Specialiste auto-entrepreneurs tout-en-un
🚀 Freebe : Simplicite et gratuit pour freelances
🆓 Henrri : Facturation 100% gratuite illimitee

Logiciel Comptabilite Auto Entrepreneur

🥇 Top 01
Indy

Indy

4.8/5

Indy est un logiciel français de comptabilité et de facturation pour indépendants, avec plan gratuit, synchronisation bancaire automatique et compte pro intégré.

Points forts

  • Plan gratuit disponible

  • Synchronisation bancaire automatique

  • Compte pro gratuit intégré

Inconvénients

  • Fonctionnalités avancées payantes

  • Conçu surtout pour indépendants

  • Pas de service comptable humain intégré

Prix

Gratuit à 49.00€ HT/mois

Utilisateurs

Par entreprise, mensuel/annuel

Essai gratuit

14 jours

Support

Chat & Email

🥈 Top 02
Freebe

Freebe

4.7/5

Freebe est le logiciel de facturation et de gestion pensé pour les freelances en France : devis et factures conformes, synchronisation bancaire, relances et déclaration URSSAF automatisées. Essai gratuit 30 jours.

Points forts

  • Interface simple et rapide : devis/factures en quelques clics, préremplissage SIRET et TVA.

  • Automatisations clés pour freelances : livre des recettes/achats, relances, déclaration URSSAF.

  • Synchronisation bancaire (450+ banques) et paiements en ligne via Stripe.

Inconvénients

  • Pas d'application mobile native (iOS/Android retirées depuis 2023).

  • Peu adapté au multi-utilisateurs et aux équipes.

  • Rythme d'évolutions fonctionnelles perçu comme plus lent.

Prix

À partir de 12,50€/mois HT

Utilisateurs

Freelances et micro-entrepreneurs

Essai gratuit

14 jours

Support

Chat & Email

🥉 Top 03
Henrri

Henrri

4.8/5

Henrri est le logiciel de facturation gratuit à vie du groupe Rivalis : factures, devis et utilisateurs illimités, sans publicité, prêt pour la facturation électronique.

Points forts

  • Factures, devis et utilisateurs illimités en version gratuite

  • Conforme anti‑fraude TVA et prête pour la facturation électronique 2026

  • Interface et support 100% français

Inconvénients

  • Pas d'application mobile complète (iOS "Henrri Pay" pour encaissement uniquement; pas d'app Android)

  • API privée, pas d'intégrations publiques (Zapier, webhooks)

  • Fonctionnalités avancées et e‑facture disponibles dans des offres payantes

Prix

Gratuit (offres payantes dès 17€ TTC/mois)

Utilisateurs

Freelances, auto-entrepreneurs, TPE de services et associations

Essai gratuit

14 jours

Support

Chat & Email

Autres alternatives à considérer

💡 Alternative
JLogiciels

JLogiciels

JLogiciels est un éditeur français (depuis 2005) de solutions de gestion modulaires en SaaS : facturation, devis, caisse, stock et CRM pour TPE/PME et artisans.

Prix:

Dès 29€/mois

Solutions sectorielles spécialisées

20+ ans d'expérience métier

💡 Alternative
iTool

iTool

iTool by EBP : comptabilité en ligne avec liasse fiscale et gestion commerciale. Essai gratuit 30 jours.

Prix:

Dès 12€/mois (compta ou facturation)

Tarifs clairs et accessibles

Liasse fiscale intégrée

💡 Alternative
Facture.net

Facture.net

Facture.net : facturation 100% gratuite à vie avec devis/clients illimités et CRM intégré.

Prix:

Hébergé: 0€/mois

Gratuit à vie, devis et factures illimités

CRM intégré pour contacts et opportunités

💡 Alternative
Swapn Compta

Swapn Compta

Swapn Compta est le cabinet d'expertise-comptable français inscrit à l'ordre qui simplifie votre gestion BNC avec l'application Tiime intégrée, un accompagnement expert personnalisé et une tarification transparente à 29€ HT/mois sans engagement.

Prix:

29€/mois HT

Expertise comptable certifiée : Cabinet inscrit à l'Ordre des Experts-Comptables avec accompagnement personnalisé et suivi professionnel de votre activité BNC

Intégration Tiime complète : Application Tiime incluse pour le suivi en temps réel de votre comptabilité et gestion administrative simplifiée

💡 Alternative
KPulse

KPulse

KPulse est un logiciel français qui centralise CRM, devis et facturation pour les TPE/PME : suivez vos clients, créez et encaissez plus vite, automatisez vos relances. Essai gratuit 15 jours.

Prix:

25.00€ HT/mois (annuel)

CRM + facturation intégrés : un seul outil pour piloter prospects, devis et factures

Essai gratuit 15 jours : testez sans engagement avant déploiement

💡 Alternative
Tiime

Tiime

Tiime : facturation gratuite et compte pro bancaire pour 200 000+ entrepreneurs.

Prix:

Gratuit (dès 17.99€ HT/mois)

Facturation gratuite illimitée

Compte pro bancaire intégré

💡 Alternative
Noalyss

Noalyss

Noalyss est un logiciel de comptabilité open source gratuit pour PME, associations et indépendants, avec facturation, TVA, multi-sociétés et multi-utilisateurs. Fiable et professionnel, anciennement PhpCompta.

Prix:

Gratuit (hébergement géré: ~17€/mois)

Entièrement gratuit : Solution open source sans coûts cachés ni abonnements

Complet et professionnel : Toutes les fonctionnalités comptables essentielles intégrées

💡 Alternative
Qonto

Qonto

Qonto est la solution française de gestion financière pour indépendants et PME : compte pro, cartes, facturation et pilotage des dépenses, intégrations comptables (Sage, Cegid, Pennylane) et API. Essai gratuit 30 jours.

Prix:

À partir de 9€/mois (HT)

Interface et support en français : Conçu pour le marché français, conformité locale

Facturation et comptabilité intégrées : Devis/factures, rapprochement automatique, export vers Sage, Cegid, Pennylane

💡 Alternative
MY.Facturation

MY.Facturation

MY.Facturation simplifie la facturation en ligne : devis, factures et clients en quelques clics, version gratuite et multi-utilisateurs sans surcoût.

Prix:

Gratuit à 50.00€ HT/mois

Interface simple et claire

Tarifs abordables TPE

💡 Alternative
MaCompta

MaCompta

MaCompta est un logiciel français de comptabilité et de facturation en ligne pour TPE, indépendants et associations : tarifs dès 8€ HT, modules à la carte (paie, immobilisations) et essai gratuit 30 jours.

Prix:

Dès 6€/mois

100 000+ utilisateurs en France, éditeur français

Tarifs clairs : facturation dès 8€ HT, comptabilité 15,90€ HT

💡 Alternative
Axonaut

Axonaut

Axonaut est un logiciel de gestion tout-en-un français pour TPE et PME qui centralise CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessible.

Prix:

À partir de 34,99 € HT/mois

Solution 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessible

320 000 utilisateurs et croissance rapide : adoptée par plus de 12 000 entreprises françaises

💡 Alternative
Pennylane

Pennylane

Pennylane est le logiciel de comptabilité français tout-en-un: facturation électronique, synchronisations bancaires, compte pro et cartes, pilotage de trésorerie en temps réel, collaboration native avec votre expert-comptable.

Prix:

14€ - 79€/mois HT

Pilotage de trésorerie en temps réel

Synchronisations bancaires et paiements intégrés

💡 Alternative
Zervant

Zervant

Zervant est un logiciel de facturation pour freelances et petites entreprises, avec plan gratuit (5 clients/5 factures/mois), e‑factures et envoi postal selon quotas, et applications mobiles iOS/Android.

Prix:

Gratuit, puis 11.00€ à 48.00€/mois

Plan gratuit: 5 clients et 5 factures/mois

Applications mobiles iOS et Android

💡 Alternative
Evoliz

Evoliz

Evoliz est un logiciel de facturation français tout-en-un pour PME, avec CRM, stocks et comptabilité intégrés. Certifié NF 203 et NF 525 pour la conformité fiscale, il permet de gérer l'ensemble de vos processus commerciaux depuis une interface unique.

Prix:

À partir de 16€/mois HT (annuel)

Certifié NF 203 et NF 525 (conformité fiscale)

Facturation, banque, stocks et CRM intégrés

💡 Alternative
FreshBooks

FreshBooks

FreshBooks simplifie la comptabilité et la facturation pour freelances et PME avec une interface ultra-simple et un suivi du temps intégré.

Prix:

Dès 16€/mois

Interface très simple et intuitive

Suivi du temps et facturation automatisés

💡 Alternative
Dougs

Dougs

Dougs est l'expert-comptable en ligne qui automatise votre comptabilité et vous accompagne au quotidien. Synchronisation bancaire, factures conformes et déclarations prises en charge, avec conseil illimité, dès 29€ HT/mois.

Prix:

Dès 29 € HT/mois

Conseil illimité et réactivité élevée des équipes

Interface simple (web + mobile) avec synchro bancaire

💡 Alternative
QuickBooks

QuickBooks

QuickBooks est le logiciel de comptabilité en ligne d'Intuit pour PME : facturation, rapprochement bancaire et tableaux de bord, simple et connecté. Solution de référence pour les indépendants et PME cherchant une interface intuitive et des automatismes comptables.

Prix:

10€/mois (offre découverte)

Logiciel de comptabilité PME reconnu mondialement

Écosystème d'intégrations riche

💡 Alternative
Xero

Xero

Xero est un logiciel de comptabilité cloud pour PME : facturation en ligne, rapprochement bancaire automatisé et 1 000+ intégrations. 4,4 M+ abonnés dans le monde.

Prix:

Hébergé: 25–65 €/mois

Rapprochement bancaire automatisé

Écosystème de 1 000+ intégrations

💡 Alternative
Sage Business Cloud Compta & Facturation

Sage Business Cloud Compta & Facturation

Sage Business Cloud Compta & Facturation : comptabilité et facturation en ligne pour TPE, synchronisation bancaire, conformité française (TVA, FEC) et application mobile.

Prix:

9.00€ - 25.00€/mois HT

100% cloud, accessible partout

Synchronisation bancaire et rapprochement automatisés

💡 Alternative
Ciel

Ciel

Ciel (Sage) simplifie la comptabilité, la facturation et la gestion commerciale des TPE‑PME en France, avec support local et conformité légale.

Prix:

À partir de 10,50€/mois

Marque Sage (Ciel) historique en France depuis 1986

Comptabilité et facturation complètes pour TPE‑PME

💡 Alternative
EBP Compta

EBP Compta

EBP Compta : comptabilité TPE/PME avec synchronisation bancaire, rapprochements automatiques et TVA automatisée.

Prix:

Dès 48.13€ HT/mois

Synchronisation bancaire automatique

Collaboration avec l’expert-comptable intégrée

💡 Alternative
EBP

EBP

EBP est l’éditeur français de référence (depuis 1984) pour la comptabilité, la gestion commerciale et la facturation des TPE/PME, avec support local et écosystème d’intégrations.

Prix:

Dès 50.40€/mois

Éditeur français depuis 1984

Suite complète pour TPE/PME

💡 Alternative
Sinao

Sinao

Sinao est un logiciel français de comptabilité et de facturation qui automatise la saisie, permet de créer des devis et des factures électroniques conformes, avec export FEC et partage fluide avec votre expert-comptable.

Prix:

Gratuit; payant dès 12€ HT/mois

Simplicité d'utilisation : interface intuitive, devis et factures en quelques minutes

Automatisation comptable : saisie automatique et transfert en un clic vers votre comptable

💡 Alternative
Kolirys

Kolirys

Kolirys est un logiciel de facturation et gestion d'entreprise 100% français et gratuit, certifié conforme loi anti-fraude TVA, conçu pour simplifier la comptabilité des auto-entrepreneurs et PME.

Prix:

Gratuit (dès 9.90€ HT/mois)

Version gratuite complète : Accès 100% gratuit avec devis, factures et clients illimités pour auto-entrepreneurs et entreprises individuelles

Conforme réglementation française : Certifié loi anti-fraude TVA et en cours d'agrément pour facturation électronique 2026

💡 Alternative
Sellsy

Sellsy

Sellsy est une suite CRM et facturation française tout-en-un, avec applications mobiles et API REST. Plébiscitée par 23 000+ clients, elle centralise ventes, devis/factures et trésorerie pour accélérer la croissance des PME.

Prix:

À partir de 29€/utilisateur/mois

Suite CRM + facturation native, conforme RGPD et hébergée en France

API REST v2 et intégrations, modules complémentaires (trésorerie)

💡 Alternative
Dolibarr

Dolibarr

Dolibarr est un ERP/CRM open source français, gratuit, avec 50+ modules pour centraliser ventes, facturation et gestion des PME. Solution 100% open source développée par une communauté active depuis 2002.

Prix:

Gratuit (hébergé: 14€/util./mois)

Complètement gratuit open source

50+ modules disponibles

💡 Alternative
Odoo

Odoo

Odoo est une suite ERP modulaire tout‑en‑un pour piloter ventes, comptabilité, stocks et projets, avec plus de 30 applications intégrées. Solution open source flexible qui s'adapte à tous les secteurs d'activité.

Prix:

Gratuit (Standard: 13,50€/util./mois)

Suite ERP tout‑en‑un (ventes, compta, achats, stock) avec workflows intégrés

Modulaire et extensible (apps officielles et milliers de modules)

💡 Alternative
DailyBiz

DailyBiz

DailyBiz est un logiciel de gestion tout-en-un pour TPE et PME : CRM, devis & facturation, gestion commerciale et comptabilité, accessible en ligne.

Prix:

Dès 45€/utilisateur/mois (engagement 36 mois)

Solution tout-en-un intégrant CRM, comptabilité et gestion commerciale

Interface entièrement française adaptée aux TPE et PME

💡 Alternative
Invoice Home

Invoice Home

Invoice Home est un logiciel de facturation en ligne simple et abordable pour créer devis, factures et reçus en quelques clics, avec 100+ modèles et paiements Stripe/PayPal.

Prix:

Gratuit puis env. 6,60 €/mois (illimité)

Interface ultra simple, prise en main immédiate

100+ modèles de facture pro + logos gratuits

💡 Alternative
INFast est un logiciel français de facturation et de gestion commerciale pour indépendants, TPE et PME. Créez devis et factures, relancez les impayés, encaissez en ligne et facturez même hors connexion. Essai gratuit 30 jours.

Prix:

À partir de 29€ HT/mois

Interface simple et prise en main rapide

Mode hors ligne (PWA), facturation partout

💡 Alternative
Keobiz est un expert-comptable en ligne qui allie la plateforme Pennylane et l'accompagnement d'un expert dédié pour piloter comptabilité, facturation et TVA des TPE/PME, dès 89€/mois.

Prix:

À partir de 89€/mois HT

Tarifs attractifs dès 89€/mois et création d'entreprise offerte

Accompagnement par un expert dédié, réactif et spécialisé par secteur

💡 Alternative
OpenConcerto

OpenConcerto

OpenConcerto est un ERP open source gratuit en français, avec comptabilité, facturation et point de vente intégrés.

Prix:

Gratuit (hébergé: 55€ HT/mois, 5 util.)

Open source gratuit: coûts maîtrisés et contrôle des données

Comptabilité, facturation et point de vente intégrés

Comparaison détaillée

LogicielPrixUsersFactu.FRMobileAPI
Indy
Indy
4.8
Gratuit à 49.00€ HT/moisPar entreprise, mensuel/annuel
Freebe
Freebe
4.7
12,50€/mois HTFreelances et micro-entrepreneurs
Henrri
Henrri
4.8
Gratuit (offres payantes dès 17€ TTC/mois)Freelances, auto-entrepreneurs, TPE de services et associations
JLogiciels
JLogiciels
5.0
Dès 29€/moisAbonnement SaaS (par utilisateur)
iTool
iTool
5.0
Dès 12€/mois (compta ou facturation)Forfait par plan (3–6 utilisateurs inclus)
Facture.net
Facture.net
4.9
Hébergé: 0€/mois100% gratuit illimité
Swapn Compta
Swapn Compta
4.9
29€/mois HT1-10 salariés
KPulse
KPulse
4.9
25.00€ HT/mois (annuel)Abonnement par utilisateur
Tiime
Tiime
4.8
Gratuit (dès 17.99€ HT/mois)Par entreprise mensuel
Noalyss
Noalyss
4.8
Gratuit (hébergement géré: ~17€/mois)Non communiqué
Qonto
Qonto
4.8
9€/mois (HT)600 000+ entreprises
MY.Facturation
MY.Facturation
4.8
Gratuit à 50.00€ HT/moisMulti-utilisateurs illimité
MaCompta
MaCompta
4.7
Dès 6€/moisPar entreprise (abonnement mensuel)
Axonaut
Axonaut
4.6
34,99 € HT/mois1 inclus (+29,99 €/user)
Pennylane
Pennylane
4.6
14€ - 79€/mois HTPar entreprise
Zervant
Zervant
4.5
Gratuit, puis 11.00€ à 48.00€/moisPar compte (mensuel)
Evoliz
Evoliz
4.4
16€/mois HT (annuel)PME et TPE françaises
FreshBooks
FreshBooks
4.2
Dès 16€/moisPar utilisateur (utilisateur supp. payant)
Dougs
Dougs
4.1
Dès 29 € HT/mois37000+ entreprises
QuickBooks
QuickBooks
4.1
10€/mois (offre découverte)7 000 000+ utilisateurs
Xero
Xero
4.0
Hébergé: 25–65 €/moisUtilisateurs illimités
Sage Business Cloud Compta & Facturation
Sage Business Cloud Compta & Facturation
4.0
9.00€ - 25.00€/mois HTPar entreprise, multi-utilisateurs
Ciel
Ciel
3.9
10,50€/moisTPE et PME françaises
EBP Compta
EBP Compta
3.9
Dès 48.13€ HT/moisPar utilisateur (selon abonnement)
EBP
EBP
3.9
Dès 50.40€/moisLicence perpétuelle & SaaS Cloud
Sinao
Sinao
3.8
Gratuit; payant dès 12€ HT/moisNon communiqué
Kolirys
Kolirys
3.8
Gratuit (dès 9.90€ HT/mois)1-50+ utilisateurs
Sellsy
Sellsy
3.8
29€/utilisateur/mois2 utilisateurs minimum
Dolibarr
Dolibarr
3.7
Gratuit (hébergé: 14€/util./mois)200 000+ organisations
Odoo
Odoo
3.6
Gratuit (Standard: 13,50€/util./mois)5 500 000+ utilisateurs dans le monde
DailyBiz
DailyBiz
2.7
Dès 45€/utilisateur/mois (engagement 36 mois)Par utilisateur mensuel
Invoice Home
Invoice Home
Non noté
Gratuit puis env. 6,60 €/mois (illimité)12M+ utilisateurs
INFast
INFast
Non noté
29€ HT/mois2 à 5 utilisateurs inclus selon le plan
Keobiz
Keobiz
Non noté
89€/mois HT20 000+ entreprises
OpenConcerto
OpenConcerto
Non noté
Gratuit (hébergé: 55€ HT/mois, 5 util.)Open source gratuit illimité

Questions
fréquentes

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