Meilleur Logiciel de Comptabilité
Comparatif des meilleures solutions de comptabilité pour TPE et PME. Analyses complètes des prix, fonctionnalités essentielles et avis d'experts pour optimiser votre gestion financière. Choisissez le logiciel comptable parfait pour automatiser vos processus et gagner en productivité.
Notre verdict en 30 secondes
Notre analyse de 8 solutions de logiciels de comptabilité 2025 pour TPE/PME révèle un classement fondé sur l’ergonomie, la couverture fonctionnelle, la collaboration avec l’expert-comptable et le coût total. Axonaut arrive 1er pour son approche tout‑en‑un rapide (facturation, banque, relances) et sa prise en main express; Pennylane se place 2e grâce au pilotage financier en temps réel et à la co‑production avec le cabinet; Sage 100 complète le podium par sa profondeur fonctionnelle et ses workflows avancés pour PME établies.
Classement
Meilleur Logiciel de Comptabilité
Axonaut
Axonaut est un logiciel de gestion tout-en-un français pour TPE et PME qui centralise CRM, facturation, comptabilité et gestion de projets dans une interface intuitive et accessible.
Points forts
- Solution 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessibles
- 32 000 utilisateurs et croissance rapide : adoptée par plus de 12 000 entreprises françaises
- Application mobile complète (iOS et Android) avec API pour intégrations avancées + MCP pour la connexion avec les LLMs
Incovénients
- Trop complet pour les micro-entreprises qui n'ont besoin que d'un seul module de gestion
- Fonctionnalités limitées pour les ETI et grands comptes nécessitant un ERP avancé
- Intégrations tierces moins nombreuses que les leaders internationaux du marché
Pennylane
Pennylane est le logiciel de comptabilité français tout‑en‑un: facturation électronique, synchronisations bancaires, compte pro et cartes, pilotage de trésorerie en temps réel, collaboration native avec votre expert‑comptable.
Points forts
- Pilotage de trésorerie en temps réel
- Synchronisations bancaires et paiements intégrés
- Compte pro et cartes inclus pour centraliser les dépenses
Incovénients
- Automatisations avancées limitées sur le plan Basique
- Tarifs qui montent avec la taille (jusqu’à 199€/mois pour 6–15 salariés)
Sage 100
Sage 100 : ERP modulaire pour PME alliant Comptabilité, Gestion commerciale, Facturation et Paie, conforme aux obligations françaises et pensé pour la croissance.
Points forts
- Suite modulaire PME éprouvée (Compta, Gestion co, Paie)
- Conformité française (FEC, DSN) et support local
- Intégration poussée avec processus métiers
Incovénients
- Interface datée par rapport aux ERP cloud récents
- Coût total élevé sur déploiements complets
- Paramétrage et maintenance nécessitant expertise
Swapn Compta
Points forts
- Expertise comptable certifiée : Cabinet inscrit à l'Ordre des Experts-Comptables avec accompagnement personnalisé et suivi professionnel de votre activité BNC
- Intégration Tiime complète : Application Tiime incluse pour le suivi en temps réel de votre comptabilité et gestion administrative simplifiée
- Tarification transparente : Formule tout inclus à 29€ HT/mois sans engagement avec télétransmission TVA et synchronisation bancaire
Incovénients
- Bilan et liasse en supplément : À partir de 199€ HT/an en plus de l’abonnement
- Outils Tiime facturés séparément : 14,90€ HT/mois après période offerte
- Pas d’API publique : Intégrations limitées hors écosystème Tiime
FreshBooks
Points forts
- Interface très simple et intuitive
- Suivi du temps et facturation automatisés
- Intégrations et synchronisation bancaires solides
Incovénients
- Interface en français indisponible (factures multilingues uniquement)
- Pas d’édition des déclarations fiscales locales
- Fonctionnalités avancées réservées aux plans supérieurs
iTool
Points forts
- Tarifs clairs et accessibles
- Liasse fiscale intégrée
- Filiale du groupe EBP reconnu
Incovénients
- Automatisation limitée entre modules
- Nécessite connaissances comptables
- Interface moins moderne que concurrents
Henrri
Henrri est le logiciel de facturation gratuit à vie du groupe Rivalis : factures, devis et utilisateurs illimités, sans publicité, prêt pour la facturation électronique.
Points forts
- Factures, devis et utilisateurs illimités en version gratuite
- Conforme anti‑fraude TVA et prête pour la facturation électronique 2026
- Interface et support 100% français
Incovénients
- Pas d’application mobile complète (iOS "Henrri Pay" pour encaissement uniquement; pas d’app Android)
- API privée, pas d’intégrations publiques (Zapier, webhooks)
- Fonctionnalités avancées et e‑facture disponibles dans des offres payantes
Tiime
Points forts
- Facturation gratuite illimitée
- Compte pro bancaire intégré
- Prêt pour la facturation électronique 2026
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes
- Pas de gestion de stock native
- Aucune API publique
Indy
Indy est un logiciel français de comptabilité et de facturation pour indépendants, avec plan gratuit, synchronisation bancaire automatique et compte pro intégré.
Points forts
- Plan gratuit disponible
- Synchronisation bancaire automatique
- Compte pro gratuit intégré
Incovénients
- Fonctionnalités avancées payantes
- Conçu surtout pour indépendants
- Pas de service comptable humain intégré
Cegid
Cegid est un éditeur français de référence depuis 1983 : une suite cloud modulable pour piloter ERP, comptabilité et RH, accélérer la conformité (DSN, fiscalité) et unifier vos processus de gestion.
Points forts
- Suite cloud ERP, comptabilité et RH modulable
- Expertise métiers et secteurs (compta, paie, retail)
- APIs et intégrations pour connecter l’écosystème
Incovénients
- Tarifs élevés et complexes
- Implémentation longue
- Interface à moderniser
Axonaut 🏆
- Tout-en-un : facturation, CRM, compte pro et bien plus dans une interface intuitive, pensée pour les petites équipes.
- Essayez Axonaut : le logiciel de gestion préféré des entrepreneurs français, déjà adopté par plus de 300 000 utilisateurs.
- Gagnez du temps, évitez les erreurs et centralisez l’essentiel. La gestion devient naturelle, accessible, agréable.
Comparaison détaillée
Axonaut 🏆
Swapn Compta
Cegid
Indy
Tiime
Pennylane
Henrri
iTool
Sage Business Cloud Compta & Facturation
FreshBooks
Questions
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